Cluster 1 Contig 1406

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Size of Consensus sequence = 2451

Number of sequences = 50

Minimum redundancy = 6

Key

A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
a
b
c
d
e
f
g
h
i
j
k
l
m
n
o
p
q
r
s
t
u
v
w
x

12 SNPs detected


A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x cosegregation weighted

1711 . . . . . . . . . T T T T T T T G T T T G G G G G . T . T G G T . T T . . G G G G . . . . . . . . . 10/12 45.00 1768 . . . . . . . . . . . C C C C C T C C C T T T T T T C . C T T C . C C . . T T T T . . . . . . . . . 10/12 43.33 1883 . . . . . . . . . . . . . T T T C T T T C C C C C C T T T C C T C T T T . C C C C . . . . . C C C C 10/12 51.67 1906 . . . . . . . . . . . . . . A A G A A A G G G G G G A A A G G A G A A A . G G G G . . . . . G G G G 10/12 50.00 1930 . . . . . . . . . . . . . . . T C T T T C C C C C C T T T C C T C T T T . C C C C . . . . C C C C C 10/12 50.00 1948 . . . . . . . . . . . . . . . T A T T T A A A A A A T T T A A T A T T T . A A A A . . . . A A A A A 10/12 50.00 1957 . . . . . . . . . . . . . . . C . C C C T T T T T T C C C T T C T C C C . T T T T . . . C T T T T T 10/12 50.00 1990 . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G A . A A A A G A G A A G A G A G . A A A A . . A A A A A A A 1/12 4.67 2085 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A A G G A G A A A A G G G G . . G G G G G G G 10/12 36.67 2112 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C C C A A C A C C C C A A A A . . A A A A A A A 10/12 36.67 2154 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A A G A G G G G A A A A A A A A A A A A A 10/12 36.67 2229 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A - A A A A - A - - - - - - - - - - - 1/12 3.33