Cluster 1 Contig 406

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Size of Consensus sequence = 1521

Number of sequences = 324

Minimum redundancy = 6

Key

A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
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U
V
W
X
Y
Z
a
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B
C
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H
I
J
K
L

34 SNPs detected


A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z A B C D E F G H I J K L cosegregation weighted

580 T T G G T . T T T T T T . T T T T T T T T T T G T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T . T T T T T T T . . T T T T T T T T T T T - T T T T - T . . . T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T - T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T . T T . T T T T - T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T . T T T . T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T . T T T T T T T . T T T T T T T T T T T T T . G T T T - T - T T T . T T T T T T - T T T T . T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T . T T T T T T T T T T T T . T T T T T T . T T T T . T T . . . . 2/34 5.43 776 . . . . . - - - - G - G - - - - G - - - - - - - - - - - - - - G G - - G - - - - - - - - - - - G G - - - - G G G G G G - - G G G G G G - G - - - G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G - - - - - - - - - - - - - - - - - G G G G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G - G - G - G G G G G G G G G G G G - G G G G G G G G G - G G - G G G G G G G G - - - - - - - G G G G G - G - G G - G G G G G G G G G G G G G G - G G G - G G G G G G G G G G - - - G G - - G - - - - - - - - - - - G - - - - - - - - - - - - - - G G - - - - G - G - - - - G - - - G G G G - - - - - G G G G - G G G - - - - - - - G G G - G - G G - - - - - - - G . - - . . . . 1/34 2.85 862 . . . . . . . C . C . C C C C C C C C C C C C T C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C T C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C T C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C T T T C C T C C C C C C C C C C C C C T T C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C . C . 1/34 2.84 1080 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A A A A A A A A A A A A A - A A A A A A A A A A - A A A A A A A A A A A A A A A A A A - A - A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A - A A A A - A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A - A A A A A A A A A A A A A A A - A A A A A A A A A A A A A A A A A A - - A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A . A A 1/34 2.61 1092 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T A . A A A A A A A A A A - A A A A A A A A A . A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A - A - A A A A A A A A A A A A A A A A - A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A - A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A - A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A - - A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A . A A 1/34 2.58 1105 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . N G T C G G G G N C G . N A G . G G G G . . G G G . G G N . G G G G G G G A G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G N G G G N G G G G A G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G N G G G N - N T G G G G T G N G N G G N G G G G G G G G G G G G G G G G G C G G G G T G G T G G G G G G G G N G G N C N N G N G G G G G G N G G G G G G N G G G G G G G G G N G G A N G G G G G G G G G G G G G G T G G G G G G G C G G G A G A N G A G - G G G G G A A G T G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G N G A A G G G G G G A G . G G 1/34 0.01 1113 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A A A A A A A A A A - . A A A . A A A A . . A A A . A A A . A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A - A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A - A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A - A A A A A A A A A A - - - A - - A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A . A A 1/34 2.52 1114 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . - - - - - - - - - - - . - - - . - - - A . . - - - . - - - . - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A - - - - - - - A A - - - - - - - - - - - - - - - A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - . - - 3/34 7.57 1117 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T T T T T T T T . T T . T T T . T T T - . . T T T . T T T . T T G T T T T - T T T T T T - T T T T T T T T T T T T G T T T T T T T T T T T T T T T T T T - T T G T T - - T T T T T T T T T T T T T T T - T - - T T T T G T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T - T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T - T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T . T T 1/34 2.51 1134 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . G . . . . G . . . . . . G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G A G G G G G G G G G A G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G A G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G C G G G G G T G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G A G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G T A N G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G A G G G G G G G G G G G G G G G G G T G G G G G G G G G G G G G G G G G G N G G G . G G 1/34 1.68 1136 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A C A A A A A A A A A A A A A A - - - A A A A A A A A A C A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A T - A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A C A A A A A A A A C A A A A A A C A A A A A A A - A - A A - - A A A A A A A A A A A A A C A A A A A A C A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A A . A A 1/34 2.30 1149 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C C C . . . . C C C C . C C C C C C C C C C . C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C . . C . C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C - . . C . . C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C . C C C C . C C C C C C C - C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C - C C C C C C C C C C - C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C - C C C - C C C C C C C C C C C - C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C C - C C C C C C C C C C C . C C 1/34 2.16 1150 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - N . . . . - T - - . - - - - - - - - - - . - - - - T - - - - - - - - - - - - - - - - C - . . - . - - - N - - - - - - - - - - - - - - - T - . . T . . T - - - - N T T - - - T - - - - - - - T T T T T T - - - . - - - - . T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N - - - - - - - - - - - - T T T - - - - - - - - - T - - - - - - - - - - - - - T - - - - - - - - - - - - - - - N - - - - - - - - T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - . - - 1/34 0.02 1151 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T T . . . . - . T T . T T T T T T T T T T . T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T . . T . T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T - . . T . . T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T . T T T T . T T C T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T - T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T - T T T T T C T T T T T T T T T T T - T - T - T - T T T - T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T - T T T T T T T T T T . T T 1/34 2.15 1159 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - . . . . A . . . . . A A . A A . A A A . . A A A - A A A A A A A A A A A A A A A A - . . . . . A - A - A A - - A A A A A A A - - A A - . . . - . . - A A A A - - - A A A - A . . A A A A - - - - - - A A . . . A A A . A A A A A A - C - . A A A A A . A A A A A - - A A A A A - A A A A A A A A A A A A - A A A - A A A A A A - - - A A A A A A A - A A - - - - - A A A A A A A A A A - - - A - - - A A - - - A A A A A A A A A A A A A A A - A A A A A A A A - A A A A A A A A A A A - A A A A A A A A A A A A . A A 1/34 2.00 1163 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . G . . . . . . G . G G . G G . . . G G G G G G G G G G G G G G G G G G G G A . . . . . N A G N G G G G G N G G G G N G G G N G . . . G . . 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C C 1/34 1.95 1172 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . T . T T . T T . . . T T T T T T T T T T T N T T T T T T T T T . . . . . T T T T T T T T T C C T T T T T T T T T . . . T . . C T T T T T T T T T T T T . . C C T T T N T T T T T T . . . T T T . T T . T T T T . T . T T T T T . T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T . T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T - T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T C T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T T . T T 1/34 0.15 1173 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . C C . C C . . . C . C C C C C C C C C T C C C C C C C C C . . . . . C T C C C - C C C T T T - C C C C C C - . . . C . . 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