Cluster 1 Contig 4164

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Size of Consensus sequence = 1570

Number of sequences = 56

Minimum redundancy = 6

Key

A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
a
b
c
d
e
f
g
h
i
j
k
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m
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p
q
r
s
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u
v
w
x
y
z
A
B
C
D

15 SNPs detected


A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z A B C D cosegregation weighted

115 A G A A G A A A G . A A A A G A A A A A A G G G A G A A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13/15 43.33 119 G G G A G A G G G . G G A G G G G G G G A G G G G G G A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1/15 3.33 135 T T C C T C T T T . T T C T T T T T T T C T T T T T T C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1/15 3.33 773 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . A G A A A G G . . . A G G . . . . . . . . . . . 13/15 18.57 782 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A C . C A C C C A A . . . C A A . . . . . . . . . . . 13/15 18.57 956 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A A A G A A A G G G G G A G G . . G . . . . A . A G 13/15 30.95 1046 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A G G A A A G G G G G A G G G A G . . . . A . A G 13/15 32.50 1067 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C C C T C C C T T T T T C T T T C T . . T . C . C T 13/15 34.05 1134 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G G A G G G A A A A A G A A A G A A . A G G . G A 13/15 37.14 1149 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C C C G C C C G G G G G C G G G C G G . G C C . C G 13/15 37.14 1151 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G G A G G G A A A A A G A A A G A A . A G G . G A 13/15 37.14 1158 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T T G T T T G G G G G T G G G T G G . G T T . T G 13/15 37.14 1239 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T T T C C C T C T C C T T C C C C T T T T T 13/15 35.60 1264 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G G C C C C C G C C C G C C C C G G C G C 13/15 34.05 1409 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . A C C A A A A C C C C C 13/15 21.67