Base	A B C D 
1 . . . G
2 . . . G
3 . . . C
4 . . . C
5 . . . G
6 . . . C
7 . . . T
8 . . . T
9 . . . C
10 . . . C
11 . . . T
12 . . . T
13 . . . C
14 . . . C
15 . . . A
16 . . . A
17 . . . C
18 . . . G
19 . . . A
20 . . . G
21 . . . A
22 . . . G
23 . . . T
24 T . . T
25 C . . C
26 A . . A
27 C . . C
28 A . . A
29 G . . G
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33 C . . C
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39 A . . A
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47 G . . G
48 T . . T
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50 A . . A
51 G . . G
52 A . . C
53 T . . T
54 G . . G
55 C . . C
56 C . . C
57 N . . -
58 A . . A
59 A . . A
60 A . . A
61 G . . G
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67 G G G G
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74 C C C C
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78 T C C T 2 transition
79 C C C C
80 G G G G
81 C T T C 2 transition
82 T T T T
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98 G G G G
99 G G G G
100 A A A A
101 T A A T 2 transversion
102 G G G G
103 A A A A
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109 G G G G
110 A A A A
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200 T T T T
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205 A A A A
206 C T T C 2 transition
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209 C C C C
210 C C C C
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240 G G G G
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252 G G G G
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263 G G G G
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295 C C C C
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299 T T T T
300 G G G G
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302 . A A A
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305 . G G G
306 . G G G
307 . G G G
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310 . C C G
311 . A A A
312 . T T T
313 . G G G
314 . G G G
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316 . T T T
317 . C . C
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331 . . . A
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340 . . . A
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350 . . . A
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366 . . . G
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376 . . . T
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378 . . . G
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