Base	A B C D 
1 T . . .
2 C . . .
3 T . . .
4 T . . .
5 C . . .
6 T . . .
7 T . . .
8 C . . .
9 G . . .
10 A . . .
11 C . . .
12 A A A A
13 A A A A
14 G G G G
15 T T T T
16 C C C C
17 T T T T
18 T T T T
19 G G G G
20 A A A A
21 G G G G
22 A A A A
23 G G G G
24 C C C C
25 C C C C
26 A A A A
27 A A A A
28 A A A A
29 C C C C
30 A A A A
31 T T T T
32 G G G G
33 T T T T
34 C C C C
35 G G G G
36 T T T T
37 C C C C
38 G G G G
39 T T T T
40 C C C C
41 T T T T
42 T T T T
43 C C C C
44 T T T T
45 T T T T
46 C C C C
47 T - - T 2 indel
48 T - - T 2 indel
49 C - - C 2 indel
50 A A A A
51 A A A A
52 T T T T
53 C C C C
54 T T T T
55 C C C C
56 A A A A
57 T T T T
58 C C C C
59 G G G G
60 T T T T
61 C C C C
62 G G G G
63 T T T T
64 T T T T
65 T T T T
66 A A A A
67 G G G G
68 A A A A
69 T T T T
70 T T T T
71 A A A A
72 T T T T
73 T T T T
74 C C C C
75 A A A A
76 C C C C
77 A A A A
78 G G G G
79 C C C C
80 C C C C
81 A A A A
82 A A A A
83 A A A A
84 C C C C
85 T T T T
86 C C C C
87 C C C C
88 C C C C
89 A A A A
90 A A A A
91 G G G G
92 C C C C
93 T T T T
94 C C C C
95 C C C C
96 A A A A
97 T T T T
98 T T T T
99 A A A A
100 T T T T
101 A A A A
102 A A A A
103 A A A A
104 C C C C
105 C C C C
106 C C C C
107 A A A A
108 A A A A
109 A A A A
110 A A A A
111 G G G G
112 C C C C
113 C C C C
114 C C C C
115 T T T T
116 C C C C
117 T T T T
118 T T T T
119 A A A A
120 G G G G
121 C C C C
122 C C C C
123 T T T T
124 C C C C
125 A A A A
126 T T T T
127 C C C C
128 G G G G
129 C C C C
130 C C C C
131 A A A A
132 A A A A
133 A A A A
134 A A A A
135 C C C C
136 A A A A
137 C C C C
138 C C C C
139 C C C C
140 A A A A
141 A A A A
142 A A A A
143 C C C C
144 C C C C
145 T T T T
146 C C C C
147 T T T T
148 C C C C
149 T T T T
150 T T T T
151 T T T T
152 C C C C
153 T T T T
154 T T T T
155 C C C C
156 A A A A
157 A A A A
158 A A A A
159 A A A A
160 G G G G
161 G G G G
162 C C C C
163 C C C C
164 C C C C
165 A A A A
166 T T T T
167 C C C C
168 A A A A
169 C C C C
170 T T T T
171 T T T T
172 T T T T
173 C C C C
174 C G G C 2 transversion
175 A A A A
176 A A A A
177 A A A A
178 G G G G
179 A A A A
180 A A A A
181 T T T T
182 A A A A
183 C C C C
184 C C C C
185 A A A A
186 A A A A
187 C C C C
188 C C C C
189 A A A A
190 T T T T
191 A A A A
192 T T T T
193 C C C C
194 C C C C
195 T T T T
196 C C C C
197 A A A A
198 T T T T
199 C C C C
200 G G G G
201 A A A A
202 A A A A
203 A A A A
204 T T T T
205 T T T T
206 A A A A
207 C C C C
208 C C C C
209 A A A A
210 T T T T
211 C C C C
212 T T T T
213 G G G G
214 C C C C
215 A A A A
216 T T T T
217 C C C C
218 A A A A
219 G G G G
220 C C C C
221 T T T T
222 T T T T
223 C C C C
224 A A A A
225 G G G G
226 C C C C
227 A A A A
228 T T T T
229 C C C C
230 A A A A
231 G G G G
232 C C C C
233 T T T T
234 G G G G
235 C C C C
236 G G G G
237 G G G G
238 C C C C
239 A A A A
240 T T T T
241 C C C C
242 A A A A
243 G G G G
244 C C C C
245 T T T T
246 G G G G
247 C C C C
248 A A A A
249 T T T T
250 C C C C
251 T T T T
252 T T T T
253 C C C C
254 G G G G
255 G G G G
256 C C C C
257 T T T T
258 T T T T
259 C C C C
260 A A A A
261 A A A A
262 G G G G
263 C C C C
264 T T T T
265 C C C C
266 G G G G
267 A A A A
268 T T T T
269 G G G G
270 T T T T
271 C C C C
272 T T T T
273 C C C C
274 T T T T
275 G G G G
276 C C C C
277 A A A A
278 A A A A
279 T T T T
280 C C C C
281 C C C C
282 A A A A
283 T T T T
284 T T T T
285 G G G G
286 A A A A
287 A A A A
288 G G G G
289 A A A A
290 G G G G
291 C C C C
292 T T T T
293 C C C C
294 C C C C
295 C C C C
296 A A A A
297 C C C C
298 C C C C
299 A A A A
300 A A A A
301 A A A A
302 G G G G
303 C C C C
304 T T T T
305 T T T T
306 C C C C
307 A A A A
308 A A A A
309 G G G G
310 A A A A
311 G G G G
312 A A A A
313 T T T T
314 A A A A
315 G G G G
316 T T T T
317 T T T T
318 A A A A
319 A A A A
320 G G G G
321 C C C C
322 T T T T
323 C C C C
324 T T T T
325 T T T T
326 C C C C
327 . C C C
328 . A A A
329 . G G G
330 . T T T
331 . C C C
332 . C C C
333 . G G G
334 . T T T
335 . A A A
336 . C C C
337 . A A A
338 . A A A
339 . G G G
340 . A A A
341 . A A A
342 . T T T
343 . C C C
344 . G G G
345 . A A A
346 . A A A
347 . G G G
348 . G G G
349 . C C C
350 . C C C
351 . A A A
352 . A A A
353 . G G G
354 . T T T
355 . A A A
356 . C C C
357 . G G G
358 . A A A
359 . G G G
360 . C C C
361 . A A A
362 . G G G
363 . C C C
364 . T T T
365 . C C C
366 . T T T
367 . T T T
368 . G G G
369 . T T T
370 . T T T
371 . C C C
372 . T T T
373 . A A A
374 . C C C
375 . G G G
376 . G G G
377 . C C C
378 . A A A
379 . A A A
380 . G G G
381 . A A A
382 . A A A
383 . C C C
384 . C C C
385 . T T T
386 . C C C
387 . A A A
388 . A A A
389 . G G G
390 . C C C
391 . C C C
392 . T T T
393 . T T T
394 . T T T
395 . A A A
396 . G G G
397 . A A A
398 . T T T
399 . G G G
400 . A A A
401 . C C C
402 . C C C
403 . A A A
404 . A A A
405 . T T T
406 . T T T
407 . C C C
408 . A A A
409 . A A A
410 . A A A
411 . A A A
412 . C C C
413 . G G G
414 . A A A
415 . A A A
416 . G G G
417 . C C C
418 . A A A
419 . A A A
420 . A A A
421 . A A A
422 . C C C
423 . A A A
424 . A A A
425 . G G G
426 . G G G
427 . T T T
428 . C C C
429 . G G G
430 . A A A
431 . G G G
432 . G G G
433 . G G G
434 . T T T
435 . T T T
436 . G G G
437 . T T T
438 . G G G
439 . T T T
440 . C C C
441 . T T T
442 . C C C
443 . T T T
444 . C C C
445 . A A A
446 . G G G
447 . G G G
448 . T T T
449 . C C C
450 . T T T
451 . G G G
452 . G G G
453 . G G G
454 . T T T
455 . C C C
456 . A A A
457 . G G G
458 . G G G
459 . G G G
460 . C C C
461 . C C C
462 . T T T
463 . A A A
464 . C C C
465 . C C C
466 . T T T
467 . T T T
468 . G G G
469 . A A A
470 . C C C
471 . T T T
472 . C C C
473 . G G G
474 . G G G
475 . A A A
476 . C C C
477 . A A A
478 . A A A
479 . G G G
480 . A A A
481 . A A A
482 . C C C
483 . G G G
484 . T T T
485 . A A A
486 . T T T
487 . A A A
488 . T T T
489 . T T T
490 . T T T
491 . C C C
492 . G G G
493 . A A A
494 . G G G
495 . G G G
496 . C C C
497 . C C C
498 . G G G
499 . A A A
500 . T T T
501 . T T T
502 . C C C
503 . C C C
504 . G G G
505 . A A A
506 . C C C
507 . T T T
508 . C C C
509 . G G G
510 . G G G
511 . T T T
512 . A A A
513 . C C C
514 . T T T
515 . C C C
516 . A A A
517 . C C C
518 . C C C
519 . A A A
520 . A A A
521 . G G G
522 . G G G
523 . G G G
524 . A A A
525 . C C C
526 . T T T
527 . C C C
528 . G G G
529 . C C C
530 . T T T
531 . G G G
532 . C C C
533 . T T T
534 . C C C
535 . T T T
536 . G G G
537 . C C C
538 . T T T
539 . C C C
540 . G G G
541 . T T T
542 . C C C
543 . A A A
544 . A A A
545 . T T T
546 . G G G
547 . G G G
548 . C C C
549 . C C C
550 . T T T
551 . C C C
552 . T T T
553 . C C C
554 . T T T
555 . G G G
556 . G G G
557 . T T T
558 . C C C
559 . G G G
560 . C C C
561 . C C C
562 . C C C
563 . A A A
564 . G G G
565 . T T T
566 . C C C
567 . G G G
568 . A A A
569 . T T T
570 . G G G
571 . A A A
572 . G G G
573 . G G G
574 . T T T
575 . T T T
576 . T T T
577 . T T T
578 . G G G
579 . C C C
580 . G G G
581 . G G G
582 . G G G
583 . T T T
584 . C C C
585 . T T T
586 . C C C
587 . G G G
588 . C C C
589 . C C C
590 . T T T
591 . G G G
592 . A A A
593 . T T T
594 . T T T
595 . T T T
596 . C C C
597 . G G G
598 . C C C
599 . G G G
600 . G G G
601 . T T T
602 . C C C
603 . C C C
604 . T T T
605 . T T T
606 . C C C
607 . T T T
608 . G G G
609 . G G G
610 . C G G
611 . G G G
612 . C C C
613 . T T T
614 . T T T
615 . C C C
616 . A A A
617 . G G G
618 . C C C
619 . . A A
620 . . G G
621 . . A A
622 . . G G
623 . . C C
624 . . T T
625 . . T T
626 . . A A
627 . . A A
628 . . C C
629 . . G A
630 . . . C
631 . . . T
632 . . . T
633 . . . C
634 . . . G
635 . . . A
636 . . . G
637 . . . G
638 . . . A
639 . . . A
640 . . . A
641 . . . T
642 . . . A
643 . . . T
644 . . . G
645 . . . G
646 . . . T
647 . . . T
648 . . . T
649 . . . T
650 . . . G
651 . . . A
652 . . . T
653 . . . A
654 . . . T
655 . . . G
656 . . . T
657 . . . T
658 . . . G