Cluster 1 Contig 4

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Size of Consensus sequence = 1322

Number of sequences = 54

Minimum redundancy = 6

Key

A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
a
b
c
d
e
f
g
h
i
j
k
l
m
n
o
p
q
r
s
t
u
v
w
x
y
z
A
B

10 SNPs detected


A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z A B cosegregation weighted

17 . G T . G . T . T G . G G . G . . . . . T T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5/10 11.11 145 T T N C C C T C C C C C C C C C T C C T C T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5/10 1.85 161 A A N C C C A C C C C C C C C C A C C A C A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5/10 1.85 163 C C C T T T C T T T T T T T T T C T T C T C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5/10 21.30 302 . . T C C C T C C C C C C C C C T C C T C T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5/10 19.44 305 . . G A A A G A A A A A A A A A G A A G A G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5/10 19.44 932 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T C T T T C T T T C T T T T C T T T T . C C T T T C C . 5/10 24.07 979 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . T T T T T T T T T T T C T T T T . C C T T T C T C 5/10 23.15 1045 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - - - C - - - - C - - - - - C C G - - C C C 5/10 20.37 1124 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C A A A A C A A A A A C C A A A C C C 5/10 17.59