MDP0000716623, MDP0000716623 (mRNA) Malus spp. (apple)

Transcript Overview


Name	MDP0000716623
Unique Name	MDP0000716623
Type	mRNA
Organism	Malus x domestica (Apple)
Sequence length	12939

Alignments

The following features are aligned


Feature Name	Type	Location	Analysis	Reference
chr13	chromosome	chr13:24530564..24543502 -	Malus x domestica Whole Genome v1.0 Assembly & Annotation	n/a
MDC007794.283	contig	MDC007794.283:50684..63622 -	Malus x domestica Whole Genome v1.0 Assembly & Annotation	n/a

Analyses

This mRNA is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Malus x domestica Whole Genome v1.0 Assembly & Annotation	2012-07-26
InterProScan of Malus x domestica Whole Genome v1.0 mRNA	2012-07-23

Relationships

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MDP0000716623_exon_1	MDP0000716623_exon_1	Malus x domestica	CDS
MDP0000716623_exon_2	MDP0000716623_exon_2	Malus x domestica	CDS
MDP0000716623_exon_3	MDP0000716623_exon_3	Malus x domestica	CDS
MDP0000716623_exon_4	MDP0000716623_exon_4	Malus x domestica	CDS

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MDP0000716623	MDP0000716623	Malus x domestica	polypeptide

InterPro

Analysis Name: InterProScan of Malus x domestica Whole Genome v1.0 mRNA
Date Performed: 2012-07-23


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR001929	Germin	PRINTS	PR00325	GERMIN	coord: 231..251 score: 2.8e-20coord: 261..281 score: 2.8e-20coord: 295..310 score: 2.8
IPR006045	Cupin 1	PFAM	PF00190	Cupin_1	coord: 205..324 score: 1.7
IPR006045	Cupin 1	SMART	SM00835	Cupin	coord: 186..330 score: 1
IPR011051	Cupin, RmlC-type	SUPERFAMILY	51182	RmlC-like cupins	coord: 205..344 score: 8.4
IPR014710	RmlC-like jelly roll fold	GENE3D	2.60.120.10	no description	coord: 203..334 score: 3.7
None	No IPR available	COIL	coil	coiled-coil	coord: 56..84 score
None	No IPR available	SEG	seg	seg	coord: 136..148 score: NAcoord: 223..234 score
None	No IPR available	SEG	seg	seg	coord: 41..59 score

Sequences

The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence
protein sequence
mRNA from alignment at chr13:24530564..24543502-
mRNA from alignment at MDC007794.283:50684..63622-
coding sequence from alignment at MDC007794.283:50684..63622-

mRNA sequence

>MDP0000716623 ID=MDP0000716623; Name=MDP0000716623; organism=Malus x domestica; type=mRNA; length=12939bp
ATGCCGATCGAGTCTGTGGATCCCTTTGAGGATGCAGGGTTTCACATAGT
GACAGAGACGTTGGATCAGACTTTCGGTCGGAGGCCAATGACATATTGTT
GGGGGATGGAAAATGTCAGGCGGCGGGAGAGTATAGCCTTGTCATCCTTG
CAGTCAAAGGGCCGGGTTACTGCTTTGACGCAGGAAATCGCTGGCTTGAG
GAATGAGCTGGCATCATACAAGTCTCAAATGTCAATGCTTGTACAAGCCC
TTAGTTCCTTAGGAATATGTCTCCCCGGTTTTTATGCACCATCGCCCTCA
GAGCACTTCCACACTGAGCAAGCACAGCAATCAGGCATGTCGACCTCCGA
CCCCGTCCCCAACCAGCAACAAGATTACCAAGTACCTCCGAACGACATGC
TTATAGATTTTTTCAGCTTTTTTTTTTGTAGTTTCGTTCCCGCTTTCTTT
TAAAACTTTATATTTGTAAGTACATTTTTATTTATATTATAAAGAAAATA
AAAACTTATTCATTAATTTGCTTTTTTTTTGTCATTAGTATGAAATCMTT
TTTTTTTTTTAATTTTCCTTTTATTCTATTTATTTTTTTATTAAACATTA
CATTTGCACGACGCCGACCAGTGGTCGCTCAAAATTAAGCACATCTTACT
ACTACGTTGCACATTACCACGCGCCTCTTACATTTTTCGTCGTGCAAACT
TTTCGAGACAAACTAGTCACAAAGCGCACTTGTACCGTTTTATATTGTAC
CACGAAAACCTTTGTCCATATAACTTTAGCGCGACGAGTAGTAAAGTGTG
GCGCAATTTCTTTTTTCACGACCTTTGCGCGACGATTTTCTAGTCACCAT
AGTTTTTTTGTGACCTAACAATGATTTACGCGACAAAAGCTCCCTCGTCG
CGCAAACTGTTTAATTTAGTAGTGCCTCTTCGTAAGTTCTCAGATTGGCC
TGTGGTATGCCCTGAACCTTGGATGGGGTAGCCTCCCCTCCCCCTGATCT
TTTAAAATACACAAATAAAAAAACTAAAAACTAAAGACTAAAGGAAATTA
CAAAATGTGCCGTAAAATTTTGTATTATTGAACGAATTCAATTTTTTTTT
TTTAATTCTTATAGTGTTATTTGCGGCTAGAGGCTGACAAACACTATTAA
CAGTCTAAGAATTATGTTACTTAGGGCTGGTTTGGTATTGCTGTGCTTTG
AAAAAAAAGCTGCTGTGAGAATAAGCGGCTGTGCTGTGAGAATAAGCGGC
TGTGAAATAAATCAGCAGAGCGTTTGGTAAACTTTTTTGTAAAAGTGCTT
TTGGAAAAAAAAGCAGTCTGATAGTGGGTCTTTTCATTAAATGAGCACTG
TAGCCCCGTGTGCTTTGAAAAAAAGCCAGTTTTCCAAAGCTGCAAATAGC
AGCTTCAGCTTTTTCCTTTGATTTCAGCTTATTCTCACAGCAGCTTCCAA
AATAAGCCCTTTTTTTCAGTTTACCAAACACCTAAAACCCTAACAGCTTT
TTTTCATAGGTGCTTTTTTTTAAGCACCTCACTCCTAAACTAGGTCTTAG
CAGCAAGAAGTACTGATGCTGTTTGAGTTAATTGGTACCCAAAATACTAG
TTTTTGTTTTCTGTTTTCTTTTTTCCGAACCAAAATACTGATTTACACCG
ACCTGGGACGCAATTGGTTGAACTAAAATGCTAGATTGTTGGTTGTTACA
AAATTTTGCAACAAGATAATATAAAACTGGGCAATGGAGGAATGGAGTCT
GGCCATACAACCACTTTGATGTTATAAGCTGCAGACCGCAGGTAATTAAC
ATTGATTAAAAGGTAGCAATGGATGTTGTTAATTCAGCCCATACCTTGAA
CCAAAAGGGTCTAACCAACAAAATAAAAAACAAAAAGGGACGTCGAAACA
TACATATACTTCTATTAATATTTATTTCTATTTAATATTAGTATTGGAGA
AGTTAAGCAAGAGTTATTATATTCTTGTTTCTATTCCAAGAAAAAAAAAA
TACAAATTAACAACTGTGGAACCGCAGCTACGACAACGATTACATTGTAA
TCTTCATCTCCAGTTTGGCAAGTCTTTCTGTACAAAGCTGTTCTCGCTAT
ACTTTTTCTATAAAGCAAAGGTTAAGCTGGAATTAACGTCTTGTGGGGGT
CAAGAATCAGAACTGAATGAACATATACCCTATTGTGTTGTAATATTATT
ACTCAACAAGGAACATTTTGTGAACAAAGCCAAATGCTCATAAGCATATA
CTTCTGTTCTACTCCATCTATATATTCAATGCTGCTCAAGATAAGCTAGA
GCCCTAACTTTCATTGTTTCCTACTGTAACTACAACGAAACATCGTAATG
TTCGACTAAGTTAACATGAAATAAATTAATATTCTAAACTGCAACTACAG
CAAGGCCTGCAGCTACAAATTAATAAATTCGAATGCTGTTGTTGCCTTCT
CTTTAGAGTTGACACAACCACCACTTTATATATAGTCCCTAGAAGCACAA
ATAACTCATCCAACTCAAATTTAGTTAATCAGGTTTCAACAATGGCCTCC
AGAACTTCCAGCCTCAAATTCTCATCACTAATAATTTTCTCATTTGCCAT
TGTCCAAATAGCAATAGCGGGAGACCCGGACATTCTTACTGACTTCATAG
TGCCTCCAAATGCAAATGGAACTGTAGATGGAAACTTCTTTACATACACC
GGCTTTCGTGCCCTTGTTGAAGGAGACCCTCCCACAGCCTTCAAGGCTAT
GAAGGCATCCTTGGCTGAATTCCCTGCTCTTAATGGGCAGAGTGTTTCAT
ATGCCATCCTTCAGTTCCCAAATGGAACTACCAACCCACCACACACTCAT
CCTCGCTCGGCTGAGCTACTTTTCCTCGTTGGTGGTACCCTTGAAGTTGG
TTTTGTTGACACCAAAAACAACCTCTTTACGCAGACGCTTCAGACAGGTG
ATCTATTTGTGTTTCCCAAGGGACTTGCGCACTTCCAATACAATGCTGAT
GCAGAAAACTCAGCCATAGCAATTTCTGCATTTGGAAGTGCAAATGCAGG
AACTGTATCAATCCCCTCCACCTTGTTCACCACCGGCATCGATGACAATG
TGTTAGCTATCTCGTTCAAGACTGATGTTGGCACCATTCAAAAGCTCAAG
GCTGGTCTTGCTCCCAAGCCGTAAAGATAGTCACAAAATCAGAGAATTGA
TGACCAGTATTACATTGTTTGTTGAATAATTACCAATAATGTGTTCAAAG
CGTGTGCCATCAACCTGTATTACATTGTTTGCCACAATTAATTTATTCTA
AACTATATGAGAACATGTCCTTGATTTGTGGTGGATTAATATTTTGGTTT
TGTATTAAATAATATTTTGATTTTACAATTCAGTATAAGGGTTAAAAAAA
AGGCCTTTTTAACCTTAATTCTTGAAAAAGATAAAAATTAATAAAAACCT
AGTGTCAGATTATATATTGGATATAGTCCCTTGATGTGTCCTTAATTCAA
ATTAATTAATGTGTATTTTATTCAATGTCTCCATTACACATTTTAATTTA
TTTTTTGACCAATTTTTTATTTATTTATTAGTTTTATTTAACATTCTTCA
AACTTGAAAGACTCAATGAATGTGCCTAAATGTTTGTACCGAAATGTTTA
TATTGAATTAATGTACCAAATGTTAGTACCAAAATGTGTAATATTGAATT
AATGTACGTAAATGTGTATACCAAAATAAATATATTAAAATATACTGAAT
GATTTAATTTACCTAAATGAAGAAGACAAAATATATCGAATATTGTACAA
CAAAACTTAGTTTATCTATGTTTACAACAAAATATATTATGATGAATTAC
ATGAAAATTATAATTATAATGAAAAATTAGAAACAGAGAAATAAAAAACA
GTAAAATATAATTAATAAATGAGGTGACTAATGTATTAAGGGACTAAAAT
TAGATTTTGATCTAACTCATGATTTTAGTCTAAAAGTCATCTTTGCCAAG
GATTAAAATCAAGTTTCCTAAAAAAAAAAAAGGGGGCACATGTCTGATTC
ATAAAACTTAAGAGTTGTGGTTAGAACAATTATGGGGAAATTGAGTAAAA
AAGAAGAATTGTTTGATGTGTGGTGTAAGTGGAGTGTGAGGTGTATATAG
TATGGAGTGTGAGGGTAGTAGCGGAAAATATGTGGGGTATATATATTAAG
ATAAACTGTAACTGAAAAAGTAGATGTGGTGTGAAATGTATGAAATGTAC
GAAATGTATGAAGTTTTCCAAAGTCCGAAGATTGAAGTGCTTGACTTCGG
ATTATAGATTGTTGAATCTTGGGAGATTGACGCCTACCGAACTACAAGCA
CAAGAGTAGGGACGAAATTCTATCTTTAGGACATTATATTTATGCAAGTC
TCAATCTCTAAGTTTGTCAGTTTTTCTAACTTTCTCTCTAGTTGTTTATA
TTAATCTTATATATAATTGATGTTGTGAATTTGTTTATTATCATTAGAAT
TACATTGTTATTTTTTCATATTTTCTGATATTGCTCCAACAACTAACATT
GATTAATAGAGAGCAATGGGTGTTGTGAATCCAGCCCATACCTTGAACCA
AAAGGGGTCTAACCAACAAAATAAACAACAAAAAGGGACATCTAAGAATC
TTACTGCCCTCATCAAACATTCCATAATTAGATATTTGGTTGTAAGCTTC
CGTCTTCCGTCTTCCACCCCCATTTGGTATCAGAGCCCAGTGAGTGGTAA
TTGCATTAGCATCTTTATAATTTGCAAGTCAGGTTCATATTTAAACTTCC
ATTTTATAGCCTATCTTATCTGTCGGTCCTCATAGTCGTTTATTTAAATT
CCCCAACCAATCAGTAAGGCGTGTTCTAAACAATAAGACCCAGGAGAGGC
ATGAGCGGGGAAGGAGTTTAGCTAACGCACAAGGAAGGTGAATCAGTATA
AGTTTTCTGTATTTTGATTGTTTGATTTGTGAACTTTATGAGTAGATTAT
TTAGATCTAATTCAATGGCCAGCATTAGCTCTAGGTCCAGTTTAGGCGCT
ATTCCTGATATTGTTAATGAAGAACAGAAACTTGATTTTCAAACTGATGA
TAGTATTGACTTTGCAGATTGGAATATCCCCAAGGTTTCAAGTAAAAATA
TTTACAAAAAGAAATGGTCAGTGGCCTCATTTAGAAGTGAACACCATGTC
AAGACAGTTGAAAAGGCTTATGCTCTTAGTAAAGAACATGAGACTTGTCA
ATTGTTTTCATCTGAACAAATTAAATCTCATAGGAAAGATGGTCATAATT
ACATTCACATTGGCTTAGTTTAGATAGCCGTAAAACCCTTAACGCGTATA
GGCCTTAATACCTTTATTTTATTATGTCTCCGAGATGCTAGATTCACTAA
TTTTAGTGACAGTATCCTTGGAATGATTGAGTCAAGCTTATACAATGGAC
CTATCCATTTTGATTGCTTTCCAGATCTTACCATATGTCTTTCAGACCCC
CACATGATGAAAGCACTCACATTAAACATCAAAACTTCAGGATATCAAGT
CCTAGAAGGAACACAGCCCTTGACATTAATTTACAGAGTCTATTACAAAG
TCACTAGCACAAATATGAATTTCCAAGCTTTAACTAAAAGTCCTAAAGAT
CATACACTTTTAATTCAAACCAATCACGAAAATTCAAACATTACAGTACC
CAGAACCATTAGGTGGTCAGATATCAGTCTACCTTCATATTGGTGTTTAA
TTAATGAAAGCAAGCCAATAGCTATCCAAAACAATCTAGTTAATCTAGAC
AACATAGAACAATACTTTGACGAGACTGTCAAAATTAATTTTGATCGTCC
AGCCAGAAGATCTTGTGAGTCAGTCCACTCACAAAAGTCATTTGCTCCTA
GCCGGAATTCTTTTTCTGGATCCATACCAACCGATAGGATGGGTCAAGAT
CAAGAGTTAATTAATTCATTAGCCAATAAGAAATTGAAAGCAGTAGACAC
TAGTTCATCCGTTACTCAACAAGAATTAATCAATGATTTGATTAATATCA
AATTAAAATCAGTAGAAACAACCTCTCAGGTTACACATCTGGTTTATCAA
CCTCAAACCCAAGATCAAGGAGAACAAACTTCTCCTACAGAAACTAATTT
TGACGCAAGTCAAATTAACCATCAACTTTTAGTTTTAAACAAACCATTTA
AAAAGAACCGCAAAAGGCTCAATGCTGATATTGAAGCCGAAGAAAACATT
CCACGAAGAAATATTTTCTGAAACAAATATACTCAAGAAGAAAAATTGGA
AATTTATAAAAAAAAATGGAATGAATTCATGCAAACACACATATTTAAAG
TATTTTTCTTTGATTATGTTGCGAAGTACTATGAGTCTGAAAAGAAATTA
GAGGTAATAACCAAAGAAAATTGGCTTAAAGAAGACAAGACTATTGTCTC
CTCCAGTCATCCTCCACAAGAAACAATTTTAATCACAAAGGGTAACAACC
AAATTCCAGCAACTTCTTTCAAATTCCCCAAGGAAGATTTAGGAGTTAAA
TCAGTCATTGAATAAAATAATTTCACTAATCAAAGTCTCCATACAATTGG
AAAACAATTAGATAAAATTGAAACTAAAATTGACAAACTCTCTCAACCAA
AACCTTTAATCAGGGAAAAAACCCTGGTTAATATCCCAGAGTCCTCAAAG
GCACTAGCCTTGAAAACAACCTCAATCTCAACAAGTCAAAAAATTAATCA
GTTGTTATTTCATTAAAAAAGGAAAAAACAGTTCATGTTTTAAAACATCC
CAATGAAACTCCATCAGAAATATCTTCATCATGCCTTGAGTCAGAAAGTG
ATTTAGATTTCATCCGAAAAGTTGAGCAAGCTTTTCACAATCTAGAACTC
AAAAGAGTAATAAATAAACGAGTCAATCTCACATCTCTTACCAAGAATTG
GTATCCCAGACCTAGTCCTCCTGATCTTTAATTTGAAGAAAGAAATATCC
AAAATTAATTTTCTATCTCTTATGATAAACTCTATGAATGGAATCTAGAT
GGTTTATCAAAACAAGAACTTCTTAACAAACTTCAACATATCTCTATGGT
TGCTAATAGTTATATTACCAATCATAATCTCAGCCAACCACAAGTTGTCG
ACATTTTGGTCACTAGATTTACAGGAATGCTCCATTCCTGGTGGGAGAAA
CATCTCACGGAACAATCCAGAAWCGAAATAATAAACGCTGTTAAAAGAGA
TGAAGAGGGAATGCCCATTTTTTATGAACACATTGGACAAGGTGTCCTTG
ACGCAATCAACACACTACTTTTTACGATCATAGAACACTTCATAGGAACA
CCTAGTAATGTCATCTCTAGGATCCATGATTAACTCAGCAATCTGAGATG
TCCAACTCTAAGCAACTTTAGATGGTATAAAGATGTGTTCATGTCTAGAG
TCATGCTCAAAGAAGGCAGTAATCAACCATTTTTTAAAGAAAAATTTATA
AATGCATTACCAAATCTTTTTGCACATAAAATCAGAAATGTTTTAGTAAA
TGAAGATGGTATTATACCATATCATACCCTTACTTATGGAAATATAATTA
ATATTATCCAAAAGGAAGACTTGAAAATGTGTATAGATGTGAAAATTTCA
AAACAAGTTAATAAAGACAAATCCATTGCTAAATATGAATTATGAACGTT
CTGTGAACAATATAGATTACCTCCTATATCTCATTCTAATAAGAAGAAAA
GGTCAGATACCTACAACAGGTATCCAACCAAATACTCCAAAAGACATCCC
AAATATAACAAATACAAAAACAAGAATTTTGAAAGAAATAAATTTTATAA
AAAACCCAAACATTCCAAATGGAAGAAGAAATTTACTAAGAAATTTCAAA
CCAAAGACCAAAGCCAAAAAGGTAAATGCTACAAATGTGGCAAATTTGGT
CATTACGCCAACAAATGTCGAGTTAAGACACTCTTAGTTCAAGCATGGAC
CAACATATTTCTTCATCAAACATCTGACTTTAGTCACTCTTAGTTCATCA
CATTTGATAAAAGTTTCAGGTTAAACTTCCCGGCATGGTTTCTTAACTCA
ACATTTGTTGGCGTAATGACCAAATTTGCCACATTTGTAGCATTTACCTT
TCTGGCTTTGGCCTTTGGTTTGAAATTTCTTATTAAATTTCTTCTTCCAT
TTGGAATGTTTGGGTTTTTCATAAAATTCATTTCTTTCAAAATTCTTGTT
TTTGTATTTGTTATATTTGGGATGTTTTTTGGAGTATTTGGTTGGATACC
TGTTGTAGGTATCTGACCTTTTCTTCTTATTAGAAGGAGCAATAAGAGGT
AATCCATATTGTTCACAGAACGTTCCTAATTCATATTTAGCTATGGATTT
GTCTTTATTAACTTGTTTTGAAAATTTCATATCTATACACATTTTCAAGC
CTTCCTTCTGGATAATATTAATTATATTTCCATAAGTAAGGGTATGATAT
GGTATAATACCATCTTCATTTACTAAAACATTTCTGATTTTATGTGCAAA
AAGATTTGGTAATCCATTTATAAATTTTTCTTTCTAAAATGGTTGATTAC
TGTCTTCTCTGAGCATGACTCTAAACACGAACACATCTTTGTACCATCTA
AAGTCGCTTAGAGTTGGACATCTCAGATTGCTGAGTTGATCATGGATCCT
AAAGGTGACATTACTAGGTGTTTCTATGAAGTGTTCTATGATTGTAAAAA
GTAGTGTGTTGATTGCGTCAAGGACACCTTGTCCAATGTGTTCATCAAAA
ATGGGTATTCCCTCTTCATCTCTTTTAACAGCATTTATTATTTCGTTTCT
AGATTGTTCCGTGAGATGTTTGTCCAATGTGGGATTGACTCGTTTATTTA
TTACTCTTTTGAGTTATAGATTTTGAAAAGCTTGCTCAACTTTTCGGATG
GAATATGAATAACTGTCTGACTCAGGGGATGATGAAGATATTTCTGATGG
AGTTTCATTGGGATATTTTAAAACATGAACTGTTTTTTCCTTTTTTAATT
CAAGTAACAACTGATCAATTTTTTGACTTGTTGAGATTGAGGTTGTTTTC
AAGGCTACTGCCTTTGAGGAGGATTCTGGGAAATTAACTAGGGGTTTTTC
CCTGATTAAAGGTTTTGGTTGAGAGAGTTTGTCAATTTTAGTTTCAATTT
TATCTAATTGTTTTCCAATTGTATGAAGACTTTGATTAGTGAAATTGTTT
TGTTCAATGATTGGTTTAACTCCTAGGTCTTCCTTGGGAACCTTGAAAGG
AGTTGCTGGAATTTGGATATTACCCTTTGTGGTTAAGATTGTTTCTTGTG
GAGGATGACTAGAGGAGTCAATAGTCTTGTCTTCTTTAAGCCAATTTTCT
TTGGTTATTACTTCTAATTTTTTTTCAGACTCATAGTACTTTTCAACATA
ATTGAAGAAAAATACTTCAAATCTGTGGGTTTCCATGAATTCGTTCCATT
ATATATATATATATATATATATATATATATAACACACACACACACACACA
CATATATATATATATATATATATCTATTATATATTTATTTCCATTTTAAT
ATAAGTGTTGGAGAAATTAAGTAAGAGTTGTAACGTTCTTGGTTTTATTC
CAAAAAAAAARRAAAAAAAAAWWACAAATTAACAACTGTGGAACCGCAGC
TACGACAACGATTACATTGTAAACTTCATCTCCTGTTACCATCAGCTTGG
CCTGCAGCAGTTGCGCATTCAAATCGTAAACCCTATAAATAGTGCCCCTT
TATAGAGCCCCAATCATCTGATCCAAATACCAAGCACATACATAGCAATA
GCGTATCACATTATTTCTGAAAGTGATCCACTATTTCTTAAACTACAACA
AAATAACTCATATTATTTCTGAAAGTGAACCAAAATAACACACGTCATTT
CTAGAACTATAGTATAATAACCCAATATTTTTTAAAGTAACAAAAATAAC
CCACATTATTTTTGAAACTACAATATAATAACTCACACTATTTCTGAAAG
TAAATCAAAATAACCCATATTATTTATGAAACTACAGTATTATAACTCAC
ACTGTTTCTGGATCTACAATATAATAACTCACACTATTTCTAAAAGTGAA
CCAAAATAACCCACACTATTCTTGAAAGTGAACCACTATTTCTTCAACTA
CAACAAATAACCCATACTATTTCTGAAAATGAACCAAAATAACCCACATT
ATTTCTTGAACTATAACATTGTAACCCACACCATTTCTGAAAGTGAACCA
AAATAACTCACACTATTTCTAGAACTACAACTACACTATTTTTGGAACTA
CAGAATAATAACCTACACTATTTTTGAAAGTGATCCAAAATAGCTCACAC
TATTTATGAAAAATAACAAAATAAACACTATTTCTAGAACTAGAACAAAA
TAACTCACACTAATTCTGGATTTGAACAAAATAACATACATTATGGCTTC
AACTGTCGCAAAATTATACACTATTTATAACGCTGAAGAAAACACACACT
ATATCTTATAGTTCTAAAAGACGCTAGGCGCTAGTCAGGTGGCTGACTGG
GTGAATGTAAGTAAATTTATTTATCTTTAGTACTTTGATGAATTTGATAG
AATGAGATGAAAATTTAAATAATTACAATTCCGTAGTATGAAGTGGCAAC
CATTTTAGAATAATATTTTTATAATTTTGGTGTTTAAAAGAATTATTGAA
TAATCGTTACATGAGCAAAAACTTTTGAATGCATTTAACTTTTTGTAGAG
ATGACTTTAAAGGACAACTTCAAAATAAACAATCAAATCGTCGTGCAACA
TTGCAGAATGAGAAAGAAAATAATACGATTTCCAAATTGATTTGTATAAA
AAAATAACAAGGTGATTTGTAAAAAACATAACATGGCGACATATAAAGCT
ACAATTCAAAACAATTGATTTGCTGATATAAAAATAATTTAATTGGATAT
TGCTACTATGTAATTTTAATTTCATGCGCAAATTTTATTTTTTATTTTTT
TTGTTGATTAATTTTGATTTTATTCACGTTGCTAGATTATTAAGATGCAT
TCCTATTGGATACATGAGTAATAGGTAACATTAATGATGATAGCTTATTT
TTGAATTTATTTAAAAGTCAAATCAATTAGTGCTACAATCAGGGACGGCC
TGATTGGGAGAATTGATGGAAACTTTTCAAAGTTTCATTTTTATATGATA
TTTAGGCTTTAACGTGTTAATGGCATAGTTGTAAATAAAGAAAAATTTGT
TACTAACGGAATTGGGCTGATATAATGAAGTTTCTGTCAATGGTATGGCT
GGAAAAAAAAATTATTGCGTGTTGGGCTTTTTATTCAGCCCATGACTCTT
AATGTTTGTAGGGTCTGATATAAGTTAGCTTTGTCCTTATAATTAAATAT
GAAACCCTTTTAGTTAAATAATAGTTTATGGTGATTTTTGGTTAAGTTAA
ACTTACTTCAAACCCTTTTCTTTAAAACTTCCTTTATAAATCCATGAAAT
TTTATGGAGTTTAATTGATTTGTAGAAATTCATGTAAAATTTTGATTCAA
TTCGCTCGAAATCTCACGGGGAGATGTGAGATTTGTATATGCCTAAAATA
CACTACAAAATCTCTAAAATTCCCTTGAATTCCTCAACTTTTTAAAATTC
TTTAAAATTAATTTCTAATTGAATACACTCAGAATGTTATAAACTGATTT
AAAATTCTAATTGAATACACCTAAATCTCTAAGAATTTTAATTATCTATC
TTAAAATTCAGATTGAATACAATTTGAATTTCAGATAATCACTTAAAATC
CTAATTGAATACCTCTAAATTCATTAAAAGAGTTAAAATCCATCAAAATC
TCAATTTGAATGCACAATACCAAATGGAGGAATCTAATCGAGAAATAGAA
ACAAAACCAAATAAACTAAAACTGAAAAAAAAAWTTAATAATAATAAGTA
CATGAGATGATCGAATAAACCAAATAAGCATAGTTTTTCCTTTGCCGAGG
AAACCATCATAGGAGAAGTGGATAGTGGGTTTCAGAATTTAATTGCACTT
CATAGACATACGTTAAAAAAACTACTACGATTTCTTTTACTGGTCTAGTT
TTGCACGATGGATAGGTGTGGTGTTTGCCTGGTTCTACGCGGTTATTGTT
TCCGTTTTTATTTTCTTAAATAGTATAGATAATTACACATTTTGAAATTT
TGCAAAATTTGGTGTACCTGCCTCCTCCAAAATTTTTCAATTAAGCGTGT
ATTGTTTTATCAGACATTATGCCCGTGGTAGATAACAAAAAGGGGTTGTG
GATACAAATAATATTGACCACGAGCATTATCCATGGTGGCTTAGTAAATT
TACAATGCGCAACTTTGTGCGTAGTCGTTCACTGCTATTTTACAACGGGC
TAAAATTTGATTGTAGTAAAAATTTGTTATTTACCGTGTGCTTGTCATGC
TCGTGGTAAAATTGTACTTTTTTTTTTAACAAACACATAAAGCCTGTGAT
AAAATTGTTATGGTAGATGAGCTATTTGTGTGGAATGGCCAGTATTGTAT
AAGGCATGGAAGTTTGAGCTGCACAAGTACTACGACACTTTTCTGACACC
TGAGGCAGCTCTTGCAGGGACTTGGATTGTCTGCCCTCCCATTTCGGTGC
CCTACCCGTGCCCTCCTGTTTTGTGTGGTCACGGTTAAGCCACGTCAATA
TTTTATATTATTTTTTATAAAAATAATAAAACAAAAAGAAATAGTAATAT
AAAATGTTGACGTGGTTTAACCGTGACCACAAAAATAGAAGGGCACGGAG
AGGGCACCACAATTAGAGGGCAGACAATCCAAGTCCCTCTTGCAGAACTA
CCCCAGGAGTTTGTGGAGAAGGTGGTCGAGTGGGAGTAG

protein sequence of MDP0000716623

>MDP0000716623 ID=MDP0000716623; Name=MDP0000716623; organism=Malus x domestica; type=polypeptide; length=447bp
MPIESVDPFEDAGFHIVTETLDQTFGRRPMTYCWGMENVRRRESIALSSL
QSKGRVTALTQEIAGLRNELASYKSQMSMLVQALSSLGICLPGFYAPSPS
EHFHTEQAQQSGMSTSDPVPNQQQDYQVSTMASRTSSLKFSSLIIFSFAI
VQIAIAGDPDILTDFIVPPNANGTVDGNFFTYTGFRALVEGDPPTAFKAM
KASLAEFPALNGQSVSYAILQFPNGTTNPPHTHPRSAELLFLVGGTLEVG
FVDTKNNLFTQTLQTGDLFVFPKGLAHFQYNADAENSAIAISAFGSANAG
TVSIPSTLFTTGIDDNVLAISFKTDVGTIQKLKAGLAPKPQPQVVDILVT
RFTGMLHSWWEKHLTEQSRXEIINAVKRDEEGMPIFYEHIGQGVLDAINT
LLFTIIEHFIGTPKGHGEGTTIRGQTIQVPLAELPQEFVEKVVEWE*

mRNA from alignment at chr13:24530564..24543502-

Legend: CDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>MDP0000716623 ID=MDP0000716623; Name=MDP0000716623; organism=Malus x domestica; type=mRNA; location=Sequence derived from: chr13:24530564..24543502- (Malus x domestica

mRNA from alignment at MDC007794.283:50684..63622-

Legend: CDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>MDP0000716623 ID=MDP0000716623; Name=MDP0000716623; organism=Malus x domestica; type=mRNA; length=12939bp; location=Sequence derived from: MDC007794.283:50684..63622- (Malus x domestica
ATGCCGATCGAGTCTGTGGATCCCTTTGAGGATGCAGGGTTTCACATAGT
GACAGAGACGTTGGATCAGACTTTCGGTCGGAGGCCAATGACATATTGTT
GGGGGATGGAAAATGTCAGGCGGCGGGAGAGTATAGCCTTGTCATCCTTG
CAGTCAAAGGGCCGGGTTACTGCTTTGACGCAGGAAATCGCTGGCTTGAG
GAATGAGCTGGCATCATACAAGTCTCAAATGTCAATGCTTGTACAAGCCC
TTAGTTCCTTAGGAATATGTCTCCCCGGTTTTTATGCACCATCGCCCTCA
GAGCACTTCCACACTGAGCAAGCACAGCAATCAGGCATGTCGACCTCCGA
CCCCGTCCCCAACCAGCAACAAGATTACCAAGTACCTCCGAACGACATGC
TTATAGATTTTTTCAGCTTTTTTTTTTGTAGTTTCGTTCCCGCTTTCTTT
TAAAACTTTATATTTGTAAGTACATTTTTATTTATATTATAAAGAAAATA
AAAACTTATTCATTAATTTGCTTTTTTTTTGTCATTAGTATGAAATCMTT
TTTTTTTTTTAATTTTCCTTTTATTCTATTTATTTTTTTATTAAACATTA
CATTTGCACGACGCCGACCAGTGGTCGCTCAAAATTAAGCACATCTTACT
ACTACGTTGCACATTACCACGCGCCTCTTACATTTTTCGTCGTGCAAACT
TTTCGAGACAAACTAGTCACAAAGCGCACTTGTACCGTTTTATATTGTAC
CACGAAAACCTTTGTCCATATAACTTTAGCGCGACGAGTAGTAAAGTGTG
GCGCAATTTCTTTTTTCACGACCTTTGCGCGACGATTTTCTAGTCACCAT
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>MDP0000716623 ID=MDP0000716623; Name=MDP0000716623; organism=Malus x domestica; type=CDS; length=1341bp; location=Sequence derived from: MDC007794.283:50684..63622- (Malus x domestica
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Annotated Terms

The following terms have been associated with this mRNA:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR001929	Germin
IPR006045	Cupin_1
IPR011051	RmlC_Cupin_sf
IPR014710	RmlC-like_jellyroll

Vocabulary: **Molecular Function**
Term	Definition
GO:0030145	manganese ion binding
GO:0045735	nutrient reservoir activity

Vocabulary: **Cellular Component**
Term	Definition
GO:0048046	apoplast