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Transcript Overview
| Name | SBE2-2 |
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| Unique Name | EF444820.1-SBE2-2.m1 |
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| Type | mRNA |
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| Organism | Malus x domestica (Apple) |
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| Source | genbank |
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| Product | starch branching enzyme II-2 |
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Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Relationships
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| SBE2-2 | EF444820.1-SBE2-2.p1 | Malus x domestica | polypeptide |
Cross References
External references for this mRNA
Alignments
| Feature Name | Type | Location | Analysis |
|---|
| EF444820 |
region |
EF444820:1448..9806+ |
NCBI Rosaceae gene and mRNA sequences |
| Chr12 |
chromosome |
Chr12:2038792..2052086- |
Malus x domestica GDDH13 v1.1 Whole Genome Assembly & Annotation |
Sequences
The
following sequences are available for this feature:
mRNA sequence >EF444820.1-SBE2-2.m1 ID=EF444820.1-SBE2-2.m1; Name=SBE2-2; organism=Malus x domestica; type=mRNA; length=2550bp
atggtctcgacactctcggggattcgcttccctctcctaccttccgccta
cacctcgcattccagcttcaatggcgatcggaggacctccggcctctctc
tcttcctctccaacacctcctcctctcggaagatctttgttggaaagcct
tcgtatgattctaatttgccatctttagcggttactgcatcgaagaaaat
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tctcgtggctatgagaagtttggcttcacacgcagtgccgaaggtatcac
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ccatacaatggcatatactatgatccaccagaagaggaaaagtatgtatt
tcaacattctcagccgagtagaccaaaatcacttcgcatttatgaggcac
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gcgttcaacatcttccaaatggaaaaatagtccctgggaacaataacagt
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cctatggtttcttgacttctgagcatcaatacatatcacgcaaggatgaa
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cgatgagcggcctcattctttcctactgtatgcaccttgtagaacagccg
tggtctacgccttcatagagggacctaaaaaggctgatatccgactctaa back to topprotein sequence of SBE2-2 >EF444820.1-SBE2-2.p1 ID=EF444820.1-SBE2-2.p1; Name=SBE2-2; organism=Malus x domestica; type=polypeptide; length=849bp
MVSTLSGIRFPLLPSAYTSHSSFNGDRRTSGLSLFLSNTSSSRKIFVGKP
SYDSNLPSLAVTASKKMLVPDSQSDGSSSLKKEQSGAASTVPEDPQVIQD
VDNVAKEDEEKLEDAPSLVVANVDDAEAKVEDTPRPLEVKASTATNKATG
KTIPPPGNGQKIYEIDSLLVGHRDHLDYRYGQYKRLREEIDKYEGGLEVF
SRGYEKFGFTRSAEGITYREWAPGAKSASLIGDFNNWNTNADVMTQNDLG
VWEIFLPNNADGSPAIPHGSRVKVRMDTPSGIKDSIPAWIKFSIQAPGEI
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WMWDSRLFNYGSWEVLRYLLSNARWWLEEYKFDGFRFDGVTSMMYTHHGL
EVAFTGNYSEYFGLATDVDAVTYLMLVNDLIHGLYPEALTIGEDVSGMPT
FCVPVEDGGVGFDYRLHMAIADKWIELLQKMDEQWQMGDIVFTLTNRRWG
ENCVAYAESHDQALVGDKTIAFWLMDKDMYDFMALDRPSTPLIDRGIALH
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GDKIIVFERGDLVFVFNFHWSNSYSDHRVGCLKPGKYKIVLDSDEKLFGG
FDRIDHSAEYFTTDGWFDERPHSFLLYAPCRTAVVYAFIEGPKKADIRL back to topmRNA from alignment at EF444820:1448..9806+ Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EF444820.1-SBE2-2.m1 ID=EF444820.1-SBE2-2.m1; Name=SBE2-2; organism=Malus x domestica; type=mRNA; length=8359bp; location=Sequence derived from: EF444820:1448..9806+ (Malus x domestica
atggtctcgacactctcggggattcgcttccctctcctaccttccgccta
cacctcgcattccagcttcaatggcgatcggaggacctccggcctctctc
tcttcctctccaacacctcctcctctcgtattccctctctctccgtttct
tttttcgtttcgaaaaaattgatattcgagttcgatttctctgtttcaat
cggctgcttcgattttctgtttatttttcagtaattaattattttttttt
tgttatataattcgtattattattgttttttaattttagtttttgaagtt
atgcgtagattgattgattgttagtggtcaccctcttagagatggagctt
acttggatatgctgtgagcttttttggaagcttggaacagtaatggagac
ttatgcttttttgaagaggacaaaaaagcatatggatttcgtttatggat
tatatggacgtaatgcctatgctttttttgtgtccgatagcaattttgaa
tttaattcttgttgaaaagaattaaaattttagaaaaaaggcattgtttt
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tttattattatttcatactttttattcgatgtttgtggtgtgtgtgtgtg
ttaagctaaattgatgcacgtttgcagggaagatctttgttggaaagcct
tcgtatgattctaatttgccatctttagcggttactgcatcgaagaaaat
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ctttcaattcaaaggttttattgggtgtgcagaatgccgtagcttagtca
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atttgatggaaggttttatttgaccagtttaggtaccttaataaggttta
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cacatgaaattcttgaagtactatctccttgtcgaactttgcatatccat
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ttgattatgcttgaccagggggatgcagagtatctaagatatcatggaat
gcaagaatttgatcgagcgatgcaacatcttgaagaaacctatggtgtaa
gtttagtcaaacgcgtacatgtgcttaattacttagggcatgggttgtgc
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cttgacttctgagcatcaatacatatcacgcaaggatgaaggagacaaaa
ttatcgtctttgaaaggggtgacctggtttttgtcttcaattttcattgg
agtaacagctattcagaccaccgagttggctgcttaaagccaggaaagta
taaggtatttcctctaaaaatttctatgaagccctcatagcctaatatac
tatctttccgcgctttcacattttctttttagaattgatctttattggtt
aagtgcatggtcatagaactcctcttcgcttattcttttcatatgataac
gctgtgtttcttcttccagattgtcttggattcagatgaaaagttattcg
gaggcttcgataggattgatcacagtgctgagtacttcactactgtaaga
aaaatttcctttggatcttctccagtgctatcatgtgtagacttcgggtg
agtacttcccggctgtaaaatattactaaccctcattgtgatctgcagga
tgggtggttcgatgagcggcctcattctttcctactgtatgcaccttgta
gaacagccgtggtctacgccttcatagagggacctaaaaaggctgatatc
cgactctaa back to topCoding sequence (CDS) from alignment at EF444820:1448..9806+ >EF444820.1-SBE2-2.m1 ID=EF444820.1-SBE2-2.m1; Name=SBE2-2; organism=Malus x domestica; type=CDS; length=2550bp; location=Sequence derived from: EF444820:1448..9806+ (Malus x domestica
atggtctcgacactctcggggattcgcttccctctcctaccttccgccta
cacctcgcattccagcttcaatggcgatcggaggacctccggcctctctc
tcttcctctccaacacctcctcctctcggaagatctttgttggaaagcct
tcgtatgattctaatttgccatctttagcggttactgcatcgaagaaaat
gcttgttcctgacagccagagtgatggctcttcgtctttgaagaaggagc
agtcgggagctgcaagtacagttccagaggatcctcaggtgattcaggac
gtagataatgtagcaaaggaagatgaagagaagcttgaggatgccccttc
attagttgtggccaatgttgatgacgctgaagccaaggttgaggacacac
ctcgtcccttagaagtgaaagcaagtactgctacaaacaaagcaacagga
aagacaattccaccgcctggcaatgggcaaaagatatatgaaatagattc
acttttggtgggtcaccgtgatcaccttgattaccgttatggacaataca
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tctcgtggctatgagaagtttggcttcacacgcagtgccgaaggtatcac
ttatagggagtgggcacctggagcaaagtcagcatcactgattggagatt
tcaacaattggaacacgaatgcagatgtgatgactcagaatgacttggga
gtctgggagatctttttgccaaacaatgcagatggctcacctgcaattcc
ccatggttctcgagtgaaggtccgtatggatactccttcaggcatcaaag
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tcaacattctcagccgagtagaccaaaatcacttcgcatttatgaggcac
atgttggaatgagtagcacggagcccaaaattaacacgtttgctgaattc
agagatgatgtgcttccacgcattaaaaaacttggttacaatgctgttca
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ttgatggaaccgatagtcattacttccactctgggtctcgaggatatcat
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tctaccctgaagctcttaccattggtgaagatgttagtggaatgccaaca
ttctgtgttcctgttgaagatggtggtgttggatttgattatcgcctgca
tatggctattgctgataaatggattgagctcctccagaaaatggatgaac
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gagaattgtgttgcttatgccgaaagtcatgaccaagctcttgttggtga
caaaacaattgcattttggctgatggacaaggatatgtatgatttcatgg
ctctggatagaccatcaactccccttatagatcgtggaatagcattacat
aaaatgattaggcttattactatgggattaggcggagaaggatatctgaa
tttcatgggaaatgaatttggacatcctgagtggattgattttccaagag
gcgttcaacatcttccaaatggaaaaatagtccctgggaacaataacagt
tttgacaaatgccgacgtagatttgatcttggggatgcagagtatctaag
atatcatggaatgcaagaatttgatcgagcgatgcaacatcttgaagaaa
cctatggtttcttgacttctgagcatcaatacatatcacgcaaggatgaa
ggagacaaaattatcgtctttgaaaggggtgacctggtttttgtcttcaa
ttttcattggagtaacagctattcagaccaccgagttggctgcttaaagc
caggaaagtataagattgtcttggattcagatgaaaagttattcggaggc
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cgatgagcggcctcattctttcctactgtatgcaccttgtagaacagccg
tggtctacgccttcatagagggacctaaaaaggctgatatccgactctaa back to top
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