|
Marker Overview
Name | JPsnpHou00078 |
dbSNP ID | N/A |
Type | SNP |
SNP Alleles | A/G |
5' Flanking Sequence | GGATTTTACAATGATTATGACTTAAGGGGCTATAAGATCAGTGTTGGAATGGCGGAGAGA
TCAGCTCCAAGGCCTTCGTTTGAACGAAGGTGGTGGTGGCGGTAGAGGTGGATATGGTGG
TGGTGACAGGCGCAACAGTTATAGAGACGGTGGAGCTGATAGACATCAGCACGGTGGAAA
CCGTTCGCGTCCTTACTGAGAGAATTTCCAGGTTGATATTTTCAGATGCAAGCATTGATA
TCTGTACATGCTTTCTGACCGAAAATTTGTCGCCCGTATGAGAAATCACTGAAGATGCTT
CCCGTGGCTGGGAGTTTATATTGGAATGTACTCGATGTTAGATGTGAATCCTGACCATTG
GATTGGATTTTGTTTAACTTTGATCTCCAGCTGAACTTATTTAAGTTGCTACCATGTTAC
AAGGAATAGGTTTTCCATGTAGGATTTTGTTATATTGGATTGGTTAGAGATTTTTGATCA
TGTTGTGTGGAGGCTCTTTTCCTACATCGAGGCTTTTGCTTTGCGGTGATTCTACTTCAC
CACATCAATCTAGTGTTTTAAGATCTAGTATTGTGCCAAAACGTCATGGTGCCTAAAATT
TTGCCTACCGGTTGCCTTAATTGTTCAGCTACTTACTGGGTGGGGCTTGTCTTCCTTGTG
GGTGACTGCAATGTACTTGTGGATGACAAGAATATCCGCGTAGCTACTAGCTCCTCGC |
3' Flanking Sequence | TCAACTATCATGTCCTTCATTCTGTTGCTGATGGGTGCTTGCTGTCATGTGCTTCGATTG
TATTCTTGGCATTTGCCTTGTGGTTTTCTTTCAGTTTTTAGTTTAGGCAATGATGGAGTA
CACCCTAGTAATCACTTTGCGGTCGGAGTTCAAATTGTTGTATTACATCCCAAACATTTG
CATATTTGAATCAAACCGTTTGTTTCC |
Species | Pyrus pyrifolia |
Publication | [view all] |
Contact | Toshiya Yamamoto
|
Comment | SNP position in sequence: 719 |
Publications
Year | Publication |
2014 | Terakami S, Nishitani C, Kunihisa M, Shirasawa K, Sato S, Tabata S, Kurita K, Kanamori H, Katayose Y, Takada N, Saito T, Yamamoto T. Transcriptome-based single nucleotide polymorphism markers for genome mapping in Japanese pear (Pyrus pyrifolia Nakai). Tree genetics & genomes. 2014; 10(4):853-863. |
Sequence
>JPsnpHou00078 ID=JPsnpHou00078; Name=JPsnpHou00078; organism=Pyrus pyrifolia; type=genetic_marker; length=926bp GGATTTTACAATGATTATGACTTAAGGGGCTATAAGATCAGTGTTGGAAT GGCGGAGAGATCAGCTCCAAGGCCTTCGTTTGAACGAAGGTGGTGGTGGC GGTAGAGGTGGATATGGTGGTGGTGACAGGCGCAACAGTTATAGAGACGG TGGAGCTGATAGACATCAGCACGGTGGAAACCGTTCGCGTCCTTACTGAG AGAATTTCCAGGTTGATATTTTCAGATGCAAGCATTGATATCTGTACATG CTTTCTGACCGAAAATTTGTCGCCCGTATGAGAAATCACTGAAGATGCTT CCCGTGGCTGGGAGTTTATATTGGAATGTACTCGATGTTAGATGTGAATC CTGACCATTGGATTGGATTTTGTTTAACTTTGATCTCCAGCTGAACTTAT TTAAGTTGCTACCATGTTACAAGGAATAGGTTTTCCATGTAGGATTTTGT TATATTGGATTGGTTAGAGATTTTTGATCATGTTGTGTGGAGGCTCTTTT CCTACATCGAGGCTTTTGCTTTGCGGTGATTCTACTTCACCACATCAATC TAGTGTTTTAAGATCTAGTATTGTGCCAAAACGTCATGGTGCCTAAAATT TTGCCTACCGGTTGCCTTAATTGTTCAGCTACTTACTGGGTGGGGCTTGT CTTCCTTGTGGGTGACTGCAATGTACTTGTGGATGACAAGAATATCCGCG TAGCTACTAGCTCCTCGCrTCAACTATCATGTCCTTCATTCTGTTGCTGA TGGGTGCTTGCTGTCATGTGCTTCGATTGTATTCTTGGCATTTGCCTTGT GGTTTTCTTTCAGTTTTTAGTTTAGGCAATGATGGAGTACACCCTAGTAA TCACTTTGCGGTCGGAGTTCAAATTGTTGTATTACATCCCAAACATTTGC ATATTTGAATCAAACCGTTTGTTTCC
|