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Marker Overview
Name | JPsnpHou00474 |
dbSNP ID | N/A |
Type | SNP |
SNP Alleles | T/C |
5' Flanking Sequence | CTTTGGATAAATGGCTGCACCACATACCTAAGGGTGGTCGAAGCTTAGATTGGGCCATGA
GAATGAAAATTGCCACAACTCTTGCTCAAGGAATTGCGTTCTTGCATGACAAGGTAAAAC
CGCATGTCGTGCATCGTGATATCCGTGCCAGTAATGTACTGCTTGATGAAGATTTTGGAG
CACATCTAATGGGGGTTGGTCTGTCAAAGTTTGTGCCGTATGAAGTGATGCACGAGAGGA
CAGTGATGGCTGGTGGCACGTACGGGTACCTTGCTCCAGAATTTGTCTACAGAAATGAGC
TTACAACAAAGAGTGATGTTTATAGCTTTGGTGTGCTGCTGCTTGAGATTGTGAGCGGAC
GTAGACCTGCACAGGCCGTTGATTCGGTGGGTTGGCAGAGCATTTTTGAGTGGGCAACAC
CTCTGGTGCAGGCTCATCGCTACCCGGATCTCCTGGACCCTCATATAACTGTTTCTTCT |
3' Flanking Sequence | CTGAGATTCCGGAGGCTGGTGTCATTCAAAAGGTGGTCGACCTCGTCTATGCCTGTACAC
AGCATGTCCCATCAATGCGCCCGAGGATGTCTCACATTGTTCATCAACTTCAACAGTTAG
CCCAGACTCCTGTTCCAAAGTAGTTTAATTTAGCTTCGGGCTAGTATTTATCCGTAATTC
TATGCAATAATGAGAGTTTGTAATTTGTAATTTTTATTCTCCAGTTGGTTAGGAGCCATA
ACCGGAATATAAGGTTTAGGGTTTAGCACTCTAGAGGCCATAAGTTCTATGTATTCAGTA
TTTAATCATAATATTTGTCTCTAGCAAGTTTTGTCGATATTTAACCAATGTCGGAAATAC
CGACAAAATCTGTCGATTTTAGTTGAAATTTAAGAGAGAGTCTCTCTGACGTAGAGCTTA
AGTA |
Species | Pyrus pyrifolia |
Publication | [view all] |
Contact | Toshiya Yamamoto
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Comment | SNP position in sequence: 480 |
Publications
Year | Publication |
2014 | Terakami S, Nishitani C, Kunihisa M, Shirasawa K, Sato S, Tabata S, Kurita K, Kanamori H, Katayose Y, Takada N, Saito T, Yamamoto T. Transcriptome-based single nucleotide polymorphism markers for genome mapping in Japanese pear (Pyrus pyrifolia Nakai). Tree genetics & genomes. 2014; 10(4):853-863. |
Sequence
>JPsnpHou00474 ID=JPsnpHou00474; Name=JPsnpHou00474; organism=Pyrus pyrifolia; type=genetic_marker; length=904bp CTTTGGATAAATGGCTGCACCACATACCTAAGGGTGGTCGAAGCTTAGAT TGGGCCATGAGAATGAAAATTGCCACAACTCTTGCTCAAGGAATTGCGTT CTTGCATGACAAGGTAAAACCGCATGTCGTGCATCGTGATATCCGTGCCA GTAATGTACTGCTTGATGAAGATTTTGGAGCACATCTAATGGGGGTTGGT CTGTCAAAGTTTGTGCCGTATGAAGTGATGCACGAGAGGACAGTGATGGC TGGTGGCACGTACGGGTACCTTGCTCCAGAATTTGTCTACAGAAATGAGC TTACAACAAAGAGTGATGTTTATAGCTTTGGTGTGCTGCTGCTTGAGATT GTGAGCGGACGTAGACCTGCACAGGCCGTTGATTCGGTGGGTTGGCAGAG CATTTTTGAGTGGGCAACACCTCTGGTGCAGGCTCATCGCTACCCGGATC TCCTGGACCCTCATATAACTGTTTCTTCTyCTGAGATTCCGGAGGCTGGT GTCATTCAAAAGGTGGTCGACCTCGTCTATGCCTGTACACAGCATGTCCC ATCAATGCGCCCGAGGATGTCTCACATTGTTCATCAACTTCAACAGTTAG CCCAGACTCCTGTTCCAAAGTAGTTTAATTTAGCTTCGGGCTAGTATTTA TCCGTAATTCTATGCAATAATGAGAGTTTGTAATTTGTAATTTTTATTCT CCAGTTGGTTAGGAGCCATAACCGGAATATAAGGTTTAGGGTTTAGCACT CTAGAGGCCATAAGTTCTATGTATTCAGTATTTAATCATAATATTTGTCT CTAGCAAGTTTTGTCGATATTTAACCAATGTCGGAAATACCGACAAAATC TGTCGATTTTAGTTGAAATTTAAGAGAGAGTCTCTCTGACGTAGAGCTTA AGTA
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