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Marker Overview
Name | JPsnpHou00140 |
dbSNP ID | N/A |
Type | SNP |
SNP Alleles | A/G |
5' Flanking Sequence | TGCACTTGGAATTGATTTGACAACACTTGGATTAAACTTGAATTCAACAGAAAACCTTCA
CAAGACTTTTGGTTCCCCATGGTCTGACGAGCCAGCTAAGGGTGATCCAGAGTTTAGTGT
TCCACAATGTTACTATGCTAAACAACCGCCTGCACTACATCAAGGGTATTTTTCAAAGTT
TTCCGTGGAAACGTTGTTCTATATCTTTTACAGCATGCCCAAAGACGAGGCCCAATTATA
TGCTGCCAATGAACTCAATAATAGAGGCTGGTTTTATCACAAGGAACACCGCCTATGGTT
CATAAGAGTACCCAACATGGAGCCAGTTGTGAAGACCAACACGTTTGAGAGAGGATCTTA
TCACTGCTTTGATCCCAATACCTTTGAAACTATCCGAAAGGATAATTTTCTTGTGCATTA
CGAGTTGTTGGAGAAGAGACCGGTGTTACCACAGCATTGACGGTCTTAAT |
3' Flanking Sequence | TTTTAGAATGTAAAGTTTCAGTTGACGGATGTCATTCATTAGAACGTAATTCAGTTTCTC
GTATCAATGTTCCTTCAATTTAGCAATTGTAAGCAATTGTCTTATACACCTTATTGCCGT
GTTCAGCTAATCAGCTTCTTACCCTTCTGTTTTTACCAATTTATGCGACTGCTCGAACGA
TAACTGTTGTCGGAAGTAGCTGCTGCTTTGACGCTGGGCTGCAAGGTTTAAGCATTGGAG
GTAAAATTTGTTACTTAACAGTAGTTTGATTTTTAAAAGGGTCAACTGATTGGTTGAAAT
TTTGCTATTAAAGTGCTTGTATGGACAAAAGTGTTTTGTAAAATTTCAACCTATTGTTAG
AAGAC |
Species | Pyrus pyrifolia |
Publication | [view all] |
Contact | Toshiya Yamamoto
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Comment | SNP position in sequence: 471 |
Publications
Year | Publication |
2014 | Terakami S, Nishitani C, Kunihisa M, Shirasawa K, Sato S, Tabata S, Kurita K, Kanamori H, Katayose Y, Takada N, Saito T, Yamamoto T. Transcriptome-based single nucleotide polymorphism markers for genome mapping in Japanese pear (Pyrus pyrifolia Nakai). Tree genetics & genomes. 2014; 10(4):853-863. |
Sequence
>JPsnpHou00140 ID=JPsnpHou00140; Name=JPsnpHou00140; organism=Pyrus pyrifolia; type=genetic_marker; length=836bp TGCACTTGGAATTGATTTGACAACACTTGGATTAAACTTGAATTCAACAG AAAACCTTCACAAGACTTTTGGTTCCCCATGGTCTGACGAGCCAGCTAAG GGTGATCCAGAGTTTAGTGTTCCACAATGTTACTATGCTAAACAACCGCC TGCACTACATCAAGGGTATTTTTCAAAGTTTTCCGTGGAAACGTTGTTCT ATATCTTTTACAGCATGCCCAAAGACGAGGCCCAATTATATGCTGCCAAT GAACTCAATAATAGAGGCTGGTTTTATCACAAGGAACACCGCCTATGGTT CATAAGAGTACCCAACATGGAGCCAGTTGTGAAGACCAACACGTTTGAGA GAGGATCTTATCACTGCTTTGATCCCAATACCTTTGAAACTATCCGAAAG GATAATTTTCTTGTGCATTACGAGTTGTTGGAGAAGAGACCGGTGTTACC ACAGCATTGACGGTCTTAATrTTTTAGAATGTAAAGTTTCAGTTGACGGA TGTCATTCATTAGAACGTAATTCAGTTTCTCGTATCAATGTTCCTTCAAT TTAGCAATTGTAAGCAATTGTCTTATACACCTTATTGCCGTGTTCAGCTA ATCAGCTTCTTACCCTTCTGTTTTTACCAATTTATGCGACTGCTCGAACG ATAACTGTTGTCGGAAGTAGCTGCTGCTTTGACGCTGGGCTGCAAGGTTT AAGCATTGGAGGTAAAATTTGTTACTTAACAGTAGTTTGATTTTTAAAAG GGTCAACTGATTGGTTGAAATTTTGCTATTAAAGTGCTTGTATGGACAAA AGTGTTTTGTAAAATTTCAACCTATTGTTAGAAGAC
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