|
Marker Overview
Name | JPsnpHou00268 |
dbSNP ID | N/A |
Type | SNP |
SNP Alleles | A/T |
5' Flanking Sequence | GAAACATGGTGGTATGAGGAACAAGACCATCTGAGAAACAACTGGTCTTTGGGGAAAGCT
GTTGGAAATTATTCTGGATCTTCGTTTCTTCTTCTTCCAGTATGGTGTTGTGTATCAACT
GAACATTACTGGCGGAAATACAAGTATAGCTGTTTACTTGCTATCTTGGATATACATGGT
GGTGGCTGTTGGAATCTATATAGTCCTAGCATATGCTCAGGACAAATATGCAGCAAAGGA
CCACATTTACTACCGGCTAGTTCAGCTTATTGTCATAATTGCCTTGGTACTCGTAGCCGT
GTTGCTGATTGAGTTCACTAAGTTCAACTTTCTTGATTTCATCTCAAGTCTCTTGGCATT
CATCCCTACTGGCTACGGTATAATCTTAATAGCTCAAGTACTCAGACCTTTTCTGCAGTC
TACGGTGGTGTGGGATACTGTTGTTTCGTTGGCCCGACTGTATGAT |
3' Flanking Sequence | TGATTTTCGGAGTGATTGTTATGGCTCCTGTGGCATTGCTGTCATGGTTACCTGGATTTC
AGTCAATGCAGACTAGGATCTTGTTCAATGAAGCGTTCAGCCGGGGTCTTCAGATATCTC
GTATTCTTACCGGCAAAAAGTTCCAATGAGATGCATTCAGAGGTCACGATTCTTCCATTG
GTGAATTCAGCTGCTGATCTGCACTAATCAGCACATCTTTCCTCCTCTTCTGATGCTCCT
GTGTTCAATTTGCGAGTCACCGAATTTTTTCGGGCTAGAGATTTTGTAATGAAGCAGGGT
AATTCGAGTAATTCGAGTGATTAGTTGTTAAGGATCTGGTTTTGTAAATATTTGTTCATA
TCTAGCGTAGCTTCTGTTCTATGCTAGGTAGCTTATTTGCTATTTCCCACCTATCACTTT
TTCTATTCCTCTCTCTCTAGTCTCAAGAACAGAATTTATATGCTTTTAGTCACAGAAAAG
TACCCCAAATTCAACTAAAAGTCTCATTCTTGATAAACACTTTCATGGACCGGGTTTACC
ATCACATGGTGGCCTTTGTTAAATATTTTGTTGCCTTGTGCAAGATTTTTATCCATATGA
TGTATTATTGGATCTGGATGTCATGTGACGGTAAACTTGTTTCGTATAAGTTGCTCTCCT
CATTCTTTGGTCGAGAAAGCGAACGGCCTTTGAGAAAACATTAAGTTAAAAAAAAAAAAA
C |
Species | Pyrus pyrifolia |
Publication | [view all] |
Contact | Toshiya Yamamoto
|
Comment | SNP position in sequence: 467 |
Publications
Year | Publication |
2014 | Terakami S, Nishitani C, Kunihisa M, Shirasawa K, Sato S, Tabata S, Kurita K, Kanamori H, Katayose Y, Takada N, Saito T, Yamamoto T. Transcriptome-based single nucleotide polymorphism markers for genome mapping in Japanese pear (Pyrus pyrifolia Nakai). Tree genetics & genomes. 2014; 10(4):853-863. |
Sequence
>JPsnpHou00268 ID=JPsnpHou00268; Name=JPsnpHou00268; organism=Pyrus pyrifolia; type=genetic_marker; length=1188bp GAAACATGGTGGTATGAGGAACAAGACCATCTGAGAAACAACTGGTCTTT GGGGAAAGCTGTTGGAAATTATTCTGGATCTTCGTTTCTTCTTCTTCCAG TATGGTGTTGTGTATCAACTGAACATTACTGGCGGAAATACAAGTATAGC TGTTTACTTGCTATCTTGGATATACATGGTGGTGGCTGTTGGAATCTATA TAGTCCTAGCATATGCTCAGGACAAATATGCAGCAAAGGACCACATTTAC TACCGGCTAGTTCAGCTTATTGTCATAATTGCCTTGGTACTCGTAGCCGT GTTGCTGATTGAGTTCACTAAGTTCAACTTTCTTGATTTCATCTCAAGTC TCTTGGCATTCATCCCTACTGGCTACGGTATAATCTTAATAGCTCAAGTA CTCAGACCTTTTCTGCAGTCTACGGTGGTGTGGGATACTGTTGTTTCGTT GGCCCGACTGTATGATwTGATTTTCGGAGTGATTGTTATGGCTCCTGTGG CATTGCTGTCATGGTTACCTGGATTTCAGTCAATGCAGACTAGGATCTTG TTCAATGAAGCGTTCAGCCGGGGTCTTCAGATATCTCGTATTCTTACCGG CAAAAAGTTCCAATGAGATGCATTCAGAGGTCACGATTCTTCCATTGGTG AATTCAGCTGCTGATCTGCACTAATCAGCACATCTTTCCTCCTCTTCTGA TGCTCCTGTGTTCAATTTGCGAGTCACCGAATTTTTTCGGGCTAGAGATT TTGTAATGAAGCAGGGTAATTCGAGTAATTCGAGTGATTAGTTGTTAAGG ATCTGGTTTTGTAAATATTTGTTCATATCTAGCGTAGCTTCTGTTCTATG CTAGGTAGCTTATTTGCTATTTCCCACCTATCACTTTTTCTATTCCTCTC TCTCTAGTCTCAAGAACAGAATTTATATGCTTTTAGTCACAGAAAAGTAC CCCAAATTCAACTAAAAGTCTCATTCTTGATAAACACTTTCATGGACCGG GTTTACCATCACATGGTGGCCTTTGTTAAATATTTTGTTGCCTTGTGCAA GATTTTTATCCATATGATGTATTATTGGATCTGGATGTCATGTGACGGTA AACTTGTTTCGTATAAGTTGCTCTCCTCATTCTTTGGTCGAGAAAGCGAA CGGCCTTTGAGAAAACATTAAGTTAAAAAAAAAAAAAC
|