Skip to main content
Toggle navigation
Species
Fragaria (all species)
Fragaria vesca
Fragaria x ananassa (strawberry)
Malus (all species)
Malus x domestica
Prunus (all species)
Prunus armeniaca (apricot)
Prunus avium and cerasus (sweet & tart cherry)
Prunus dulcis (almond)
Prunus persica (peach)
Prunus serotina (black cherry)
Pyrus (all species)
Pyrus communis (European pear)
Rosa (all species)
Rubus (all species)
Rubus occidentalis
All Species
Data
Data Contributors
Data Overview
Data Submission
Disclaimer
Download Data
GDR Marker Types
Gene Class
Genome Data
NCBI RNASeq and DNA Datasets
Pan-genome Data
Publication Datasets
Rosaceae Trait Ontology
Search
Search Genes and Transcripts
Search Genotype (GIGWA)
Search Genotype
Search Germplasm
Search Germplasm Images
Search Haplotype Block
Search Maps
Search Markers
Search Markers by Locus
Search Orthologs and Paralogs
Search Publications
Search QTL/GWAS
Search Sequences
Search Trait Name
Search Trait Descriptor
Search Trait Evaluation
MegaSearch
Tools
BIMS
BLAST+
Expression Heatmap
GDRCyc
GIGWA (Explore Genotype Data)
JBrowse
MapViewer
Primer3
Sequence Retrieval
Synteny Viewer
View Pan-genome
Breeding Software Tools
Other Resources
General
About
Cite GDR
GDR Citations
Newsletters
GDR Email Archive
News Archives
People
Presentations
Steering Committee
Usage
Work Completed
Work in Progress
Help
Contact
User Manual
GDR Video Tutorials
Gene Naming Guideline
Genome Naming Guideline
Community
Conferences
Employment
Mailing Lists
Mailing List Archives
RosIGI
USRosExec
Community Projects
Search form
Search
Login
Display Syntenic Blocks
Block ID
mdpafB557
Organism A
Apple
Location A
Chr05_GDDH13v1.1 : 46191220 - 47492239
Organism B
Location B
Chr3_PaF106_v1.0 : 17653322 - 18595472
Gene A
Gene B
e-value
MD05G1341500
PaF106G0300011998.01.T02
3e-26
MD05G1341600
NA
NA
MD05G1341700
NA
NA
MD05G1341800
NA
NA
MD05G1341900
NA
NA
NA
PaF106G0300011999.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012000.01.T02
NA
NA
PaF106G0300012001.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012002.01.T01
NA
MD05G1342200
PaF106G0300012004.01.T04
0
MD05G1342300
NA
NA
MD05G1342400
NA
NA
MD05G1342500
NA
NA
MD05G1342600
NA
NA
MD05G1342700
NA
NA
MD05G1342800
NA
NA
MD05G1342900
NA
NA
MD05G1343000
NA
NA
MD05G1343100
NA
NA
MD05G1343200
NA
NA
MD05G1343300
NA
NA
MD05G1343500
NA
NA
MD05G1343600
NA
NA
MD05G1343700
NA
NA
MD05G1343800
NA
NA
MD05G1343900
NA
NA
MD05G1344000
NA
NA
MD05G1344100
NA
NA
MD05G1344200
NA
NA
NA
PaF106G0300012005.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012006.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012007.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012008.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012009.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012010.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012011.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012012.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012013.01.T01
NA
MD05G1344300
PaF106G0300012014.01.T01
0
MD05G1344400
NA
NA
MD05G1344500
NA
NA
MD05G1344700
PaF106G0300012015.01.T02
8e-94
MD05G1344800
NA
NA
MD05G1344900
NA
NA
MD05G1345000
NA
NA
MD05G1345100
NA
NA
MD05G1345200
NA
NA
MD05G1345300
NA
NA
MD05G1345400
NA
NA
MD05G1345500
NA
NA
MD05G1345600
NA
NA
MD05G1345700
NA
NA
MD05G1345800
NA
NA
MD05G1346000
NA
NA
MD05G1346500
NA
NA
MD05G1346800
NA
NA
MD05G1346900
NA
NA
MD05G1347100
NA
NA
MD05G1347200
NA
NA
MD05G1347300
NA
NA
MD05G1347400
NA
NA
MD05G1347500
NA
NA
NA
PaF106G0300012016.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012017.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012018.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012020.01.T02
NA
NA
PaF106G0300012021.01.T02
NA
NA
PaF106G0300012023.01.T01
NA
MD05G1347600
PaF106G0300012024.01.T01
0
MD05G1347700
PaF106G0300012025.01.T01
1e-71
MD05G1347800
NA
NA
MD05G1347900
NA
NA
MD05G1348000
NA
NA
MD05G1348100
NA
NA
MD05G1348200
NA
NA
MD05G1348300
NA
NA
NA
PaF106G0300012027.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012028.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012029.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012031.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012032.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012033.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012036.01.T03
NA
NA
PaF106G0300012037.01.T01
NA
MD05G1348500
PaF106G0300012038.01.T01
0
MD05G1348800
NA
NA
MD05G1348900
NA
NA
MD05G1349100
NA
NA
MD05G1349200
NA
NA
MD05G1349300
NA
NA
MD05G1349400
NA
NA
NA
PaF106G0300012039.01.T03
NA
NA
PaF106G0300012040.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012041.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012043.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012044.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012045.01.T01
NA
MD05G1349500
PaF106G0300012046.01.T01
9e-27
NA
PaF106G0300012048.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012049.01.T01
NA
MD05G1349600
PaF106G0300012050.01.T01
5e-114
MD05G1349800
PaF106G0300012051.01.T02
1e-165
MD05G1349900
NA
NA
MD05G1350000
NA
NA
MD05G1350300
NA
NA
MD05G1350400
NA
NA
MD05G1350500
NA
NA
MD05G1350600
NA
NA
MD05G1350700
NA
NA
MD05G1350800
NA
NA
MD05G1350900
NA
NA
MD05G1351000
NA
NA
MD05G1351100
NA
NA
MD05G1351200
NA
NA
MD05G1351300
NA
NA
NA
PaF106G0300012052.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012053.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012054.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012057.01.T02
NA
NA
PaF106G0300012055.01.T02
NA
NA
PaF106G0300012058.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012060.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012061.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012062.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012063.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012064.01.T01
NA
MD05G1351400
PaF106G0300012065.01.T01
0
NA
PaF106G0300012066.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012067.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012068.01.T02
NA
MD05G1351500
PaF106G0300012069.01.T03
5e-154
MD05G1351600
NA
NA
MD05G1351700
NA
NA
MD05G1351900
NA
NA
MD05G1352000
NA
NA
MD05G1352100
NA
NA
MD05G1352200
NA
NA
NA
PaF106G0300012071.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012072.01.T02
NA
NA
PaF106G0300012073.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012074.01.T02
NA
MD05G1352300
PaF106G0300012075.01.T01
4e-130
MD05G1352400
NA
NA
MD05G1352500
PaF106G0300012077.01.T01
8e-110
MD05G1352600
PaF106G0300012078.01.T01
2e-138
MD05G1352700
NA
NA
NA
PaF106G0300012079.01.T01
NA
MD05G1352800
PaF106G0300012080.01.T01
0
MD05G1352900
NA
NA
MD05G1353100
NA
NA
MD05G1353200
NA
NA
MD05G1353500
NA
NA
MD05G1353600
NA
NA
MD05G1353800
NA
NA
MD05G1353900
NA
NA
NA
PaF106G0300012081.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012082.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012083.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012084.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012085.01.T04
NA
NA
PaF106G0300012086.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012087.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012088.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012089.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012090.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012091.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012094.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012095.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012097.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012098.01.T02
NA
NA
PaF106G0300012099.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012100.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012101.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012102.01.T01
NA
MD05G1354000
PaF106G0300012103.01.T01
6e-73
MD05G1354100
NA
NA
MD05G1354200
PaF106G0300012104.01.T02
5e-71
MD05G1354300
NA
NA
MD05G1354400
NA
NA
MD05G1354500
NA
NA
MD05G1354600
NA
NA
MD05G1354700
NA
NA
MD05G1354800
NA
NA
MD05G1354900
NA
NA
MD05G1355000
NA
NA
MD05G1355100
NA
NA
MD05G1355200
NA
NA
MD05G1355300
NA
NA
MD05G1355400
NA
NA
MD05G1355500
NA
NA
MD05G1355700
NA
NA
MD05G1355800
NA
NA
MD05G1355900
NA
NA
MD05G1356000
NA
NA
MD05G1356100
NA
NA
MD05G1356200
NA
NA
MD05G1356400
NA
NA
NA
PaF106G0300012106.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012107.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012108.01.T03
NA
NA
PaF106G0300012109.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012110.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012111.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012112.01.T03
NA
MD05G1356500
PaF106G0300012114.01.T01
2e-53
MD05G1356600
NA
NA
NA
PaF106G0300012115.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012116.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012117.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012118.01.T03
NA
NA
PaF106G0300012121.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012122.01.T07
NA
MD05G1356700
PaF106G0300012123.01.T01
1e-52
MD05G1356800
NA
NA
MD05G1356900
NA
NA
MD05G1357000
NA
NA
MD05G1357100
NA
NA
MD05G1357200
NA
NA
MD05G1357300
NA
NA
MD05G1357400
NA
NA
MD05G1357500
NA
NA
MD05G1357600
NA
NA
MD05G1357700
NA
NA
MD05G1357800
NA
NA
NA
PaF106G0300012124.01.T03
NA
NA
PaF106G0300012125.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012126.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012127.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012128.01.T02
NA
NA
PaF106G0300012129.01.T02
NA
NA
PaF106G0300012131.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012132.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012134.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012135.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012138.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012139.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012140.01.T03
NA
NA
PaF106G0300012141.01.T01
NA
MD05G1357900
PaF106G0300012142.01.T02
3e-15
MD05G1358000
NA
NA
MD05G1358100
NA
NA
MD05G1358200
NA
NA
MD05G1358400
NA
NA
MD05G1358500
NA
NA
MD05G1358600
NA
NA
MD05G1358700
NA
NA
MD05G1358900
NA
NA
MD05G1359000
NA
NA
NA
PaF106G0300012143.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012144.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012146.01.T02
NA
NA
PaF106G0300012147.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012149.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012150.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012152.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012155.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012158.01.T05
NA
NA
PaF106G0300012160.01.T02
NA
NA
PaF106G0300012162.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012164.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012165.01.T01
NA
MD05G1359100
PaF106G0300012166.01.T01
2e-173
MD05G1359200
NA
NA
MD05G1359300
NA
NA
MD05G1359400
NA
NA
NA
PaF106G0300012167.01.T02
NA
NA
PaF106G0300012168.01.T01
NA
MD05G1359500
PaF106G0300012170.01.T01
5e-74
MD05G1359600
NA
NA
MD05G1359700
NA
NA
MD05G1359900
NA
NA
MD05G1360000
NA
NA
MD05G1360100
NA
NA
MD05G1360200
NA
NA
NA
PaF106G0300012171.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012172.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012173.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012174.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012175.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012176.01.T01
NA
NA
PaF106G0300012177.01.T01
NA
MD05G1360300
PaF106G0300012179.01.T01
0