Skip to main content
Toggle navigation
Species
Fragaria (all species)
Fragaria vesca
Fragaria x ananassa (strawberry)
Malus (all species)
Malus x domestica
Prunus (all species)
Prunus armeniaca (apricot)
Prunus avium and cerasus (sweet & tart cherry)
Prunus dulcis (almond)
Prunus persica (peach)
Prunus serotina (black cherry)
Pyrus (all species)
Pyrus communis (European pear)
Rosa (all species)
Rubus (all species)
Rubus occidentalis
All Species
Data
Data Contributors
Data Overview
Data Submission
Disclaimer
Download Data
GDR Marker Types
Gene Class
Genome Data
NCBI RNASeq and DNA Datasets
Pan-genome Data
Publication Datasets
Rosaceae Trait Ontology
Search
Search Genes and Transcripts
Search Genotype (GIGWA)
Search Genotype
Search Germplasm
Search Germplasm Images
Search Haplotype Block
Search Maps
Search Markers
Search Markers by Locus
Search Orthologs and Paralogs
Search Publications
Search QTL/GWAS
Search Sequences
Search Trait Name
Search Trait Descriptor
Search Trait Evaluation
MegaSearch
Tools
BIMS
BLAST+
Expression Heatmap
GDRCyc
GIGWA (Explore Genotype Data)
JBrowse
MapViewer
Primer3
Sequence Retrieval
Synteny Viewer
View Pan-genome
Breeding Software Tools
Other Resources
General
About
Cite GDR
GDR Citations
Newsletters
GDR Email Archive
News Archives
People
Presentations
Steering Committee
Usage
Work Completed
Work in Progress
Help
Contact
User Manual
GDR Video Tutorials
Gene Naming Guideline
Genome Naming Guideline
Community
Conferences
Employment
Mailing Lists
Mailing List Archives
RosIGI
USRosExec
Community Projects
Search form
Search
Login
Display Syntenic Blocks
Block ID
mdrahB030
Organism A
Apple
Location A
Chr09_GDDH13v1.1 : 35723456 - 37589101
Organism B
Location B
Ra01_rah_v1 : 17002117 - 19476004
Gene A
Gene B
e-value
MD09G1280400
Ra_g3238.t1
0
MD09G1280500
NA
NA
MD09G1280600
NA
NA
MD09G1280700
NA
NA
MD09G1281000
NA
NA
MD09G1281100
NA
NA
MD09G1281200
NA
NA
NA
Ra_g3233.t1
NA
NA
Ra_g3229.t1
NA
MD09G1281300
Ra_g3228.t1
5e-81
NA
Ra_g3225.t1
NA
NA
Ra_g3224.t1
NA
MD09G1281400
Ra_g3222.t1
0
NA
Ra_g3220.t2
NA
NA
Ra_g3217.t1
NA
NA
Ra_g3216.t1
NA
NA
Ra_g3214.t1
NA
NA
Ra_g3213.t1
NA
NA
Ra_g3212.t1
NA
NA
Ra_g3209.t2
NA
MD09G1281500
Ra_g3208.t1
0
MD09G1281600
NA
NA
MD09G1281700
NA
NA
MD09G1281800
NA
NA
MD09G1281900
Ra_g3205.t1
0
NA
Ra_g3207.t2
NA
NA
Ra_g3205.t2
NA
MD09G1282000
Ra_g3204.t1
4e-76
MD09G1282100
NA
NA
NA
Ra_g3199.t1
NA
MD09G1282200
Ra_g3194.t1
0
MD09G1282400
NA
NA
MD09G1282500
NA
NA
NA
Ra_g3193.t1
NA
MD09G1282600
Ra_g3189.t1
2e-49
MD09G1282700
NA
NA
MD09G1282900
Ra_g3187.t1
5e-90
NA
Ra_g3186.t1
NA
NA
Ra_g3185.t1
NA
NA
Ra_g3183.t1
NA
NA
Ra_g3181.t1
NA
MD09G1283000
Ra_g3180.t1
0
MD09G1283100
NA
NA
MD09G1283200
NA
NA
NA
Ra_g3178.t1
NA
NA
Ra_g3177.t2
NA
NA
Ra_g3176.t1
NA
NA
Ra_g3157.t1
NA
NA
Ra_g3153.t1
NA
NA
Ra_g3146.t1
NA
NA
Ra_g3145.t1
NA
NA
Ra_g3144.t1
NA
NA
Ra_g3143.t1
NA
NA
Ra_g3142.t1
NA
NA
Ra_g3140.t1
NA
NA
Ra_g3138.t1
NA
NA
Ra_g3136.t1
NA
NA
Ra_g3135.t1
NA
MD09G1283400
Ra_g3134.t1
0
MD09G1283600
NA
NA
MD09G1283700
NA
NA
MD09G1283800
NA
NA
MD09G1283900
Ra_g3131.t1
3e-150
NA
Ra_g3130.t1
NA
MD09G1284000
Ra_g3129.t1
2e-169
MD09G1284100
NA
NA
MD09G1284200
NA
NA
NA
Ra_g3126.t1
NA
NA
Ra_g3124.t1
NA
MD09G1284300
Ra_g3123.t1
0
MD09G1284400
Ra_g3122.t1
1e-151
MD09G1284800
NA
NA
NA
Ra_g3121.t1
NA
NA
Ra_g3119.t1
NA
NA
Ra_g3115.t1
NA
MD09G1285000
Ra_g3112.t1
7e-52
MD09G1285100
Ra_g3111.t1
0
NA
Ra_g3110.t1
NA
MD09G1285300
Ra_g3109.t1
7e-21
MD09G1285400
Ra_g3108.t1
3e-72
MD09G1285500
Ra_g3107.t1
5e-107
MD09G1285600
Ra_g3106.t1
0
NA
Ra_g3106.t2
NA
NA
Ra_g3104.t1
NA
MD09G1285700
Ra_g3102.t1
3e-61
MD09G1285800
NA
NA
NA
Ra_g3099.t1
NA
MD09G1285900
Ra_g3097.t1
2e-142
MD09G1286000
Ra_g3095.t1
0
NA
Ra_g3094.t1
NA
NA
Ra_g3093.t1
NA
MD09G1286100
Ra_g3092.t1
0
MD09G1286400
Ra_g3091.t1
3e-155
MD09G1286500
NA
NA
NA
Ra_g3091.t2
NA
MD09G1286600
Ra_g3089.t1
1e-42
MD09G1286700
Ra_g3088.t1
1e-86
NA
Ra_g3087.t3
NA
MD09G1286800
Ra_g3084.t1
3e-125
MD09G1286900
Ra_g3082.t1
4e-92
MD09G1287000
Ra_g3081.t1
9e-129
MD09G1287100
Ra_g3080.t1
0
MD09G1287200
NA
NA
MD09G1287300
Ra_g3078.t1
7e-145
MD09G1287400
NA
NA
NA
Ra_g3075.t1
NA
MD09G1287700
Ra_g3074.t1
0
MD09G1287800
Ra_g3073.t1
3e-53
MD09G1287900
Ra_g3072.t1
4e-103
MD09G1288000
Ra_g3071.t1
2e-122
NA
Ra_g3070.t1
NA
NA
Ra_g3068.t1
NA
NA
Ra_g3068.t2
NA
NA
Ra_g3067.t1
NA
NA
Ra_g3066.t1
NA
MD09G1288100
Ra_g3065.t1
0
MD09G1288200
NA
NA
MD09G1288500
NA
NA
NA
Ra_g3063.t1
NA
NA
Ra_g3062.t1
NA
NA
Ra_g3056.t1
NA
NA
Ra_g3054.t1
NA
NA
Ra_g3052.t1
NA
MD09G1288800
Ra_g3051.t1
9e-74
NA
Ra_g3050.t1
NA
NA
Ra_g3049.t1
NA
NA
Ra_g3047.t2
NA
NA
Ra_g3046.t1
NA
NA
Ra_g3045.t1
NA
NA
Ra_g3044.t1
NA
NA
Ra_g3042.t1
NA
NA
Ra_g3041.t1
NA
NA
Ra_g3040.t1
NA
NA
Ra_g3039.t1
NA
NA
Ra_g3038.t1
NA
NA
Ra_g3037.t1
NA
MD09G1288900
Ra_g3036.t1
1e-50
MD09G1289100
NA
NA
MD09G1289200
NA
NA
MD09G1289400
Ra_g3035.t1
0
MD09G1289500
Ra_g3034.t1
0
MD09G1289800
NA
NA
MD09G1289900
NA
NA
MD09G1290100
Ra_g3032.t1
0
NA
Ra_g3031.t1
NA
MD09G1290300
Ra_g3030.t1
0
NA
Ra_g3029.t1
NA
NA
Ra_g3027.t1
NA
NA
Ra_g3023.t1
NA
MD09G1290400
Ra_g3022.t1
4e-79
MD09G1290500
Ra_g3021.t1
0
MD09G1290600
Ra_g3020.t1
1e-40
NA
Ra_g3019.t1
NA
MD09G1290800
Ra_g3017.t1
1e-50
MD09G1290900
NA
NA
MD09G1291100
NA
NA
MD09G1291200
Ra_g3016.t1
0
MD09G1291300
Ra_g3015.t1
0
NA
Ra_g3014.t1
NA
NA
Ra_g3013.t1
NA
MD09G1291400
Ra_g3012.t1
0
NA
Ra_g3011.t1
NA
MD09G1291500
Ra_g3010.t1
0
MD09G1291600
Ra_g3009.t1
0
MD09G1291700
Ra_g3008.t1
3e-126
NA
Ra_g3007.t1
NA
MD09G1291800
Ra_g3006.t1
3e-96
NA
Ra_g3005.t1
NA
NA
Ra_g3004.t1
NA
NA
Ra_g3002.t1
NA
NA
Ra_g3000.t1
NA
NA
Ra_g2997.t1
NA
NA
Ra_g2996.t1
NA
NA
Ra_g2995.t1
NA
NA
Ra_g2992.t1
NA
MD09G1291900
Ra_g2991.t1
1e-96
MD09G1292000
NA
NA
MD09G1292100
NA
NA
MD09G1292300
NA
NA
MD09G1292400
NA
NA
MD09G1292500
NA
NA
MD09G1292700
NA
NA
MD09G1292800
NA
NA
MD09G1292900
NA
NA
MD09G1293000
NA
NA
MD09G1293100
NA
NA
MD09G1293200
NA
NA
NA
Ra_g2989.t1
NA
NA
Ra_g2988.t1
NA
NA
Ra_g2987.t1
NA
NA
Ra_g2985.t1
NA
NA
Ra_g2984.t1
NA
NA
Ra_g2981.t1
NA
NA
Ra_g2980.t1
NA
MD09G1293300
Ra_g2978.t1
3e-81