Skip to main content
Toggle navigation
Species
Fragaria (all species)
Fragaria vesca
Fragaria x ananassa (strawberry)
Malus (all species)
Malus x domestica
Prunus (all species)
Prunus armeniaca (apricot)
Prunus avium and cerasus (sweet & tart cherry)
Prunus dulcis (almond)
Prunus persica (peach)
Prunus serotina (black cherry)
Pyrus (all species)
Pyrus communis (European pear)
Rosa (all species)
Rubus (all species)
Rubus occidentalis
All Species
Data
Data Contributors
Data Overview
Data Submission
Disclaimer
Download Data
GDR Marker Types
Gene Class
Genome Data
NCBI RNASeq and DNA Datasets
Pan-genome Data
Publication Datasets
Rosaceae Trait Ontology
Search
Search Genes and Transcripts
Search Genotype (GIGWA)
Search Genotype
Search Germplasm
Search Germplasm Images
Search Haplotype Block
Search Maps
Search Markers
Search Markers by Locus
Search Orthologs and Paralogs
Search Publications
Search QTL/GWAS
Search Sequences
Search Trait Name
Search Trait Descriptor
Search Trait Evaluation
MegaSearch
Tools
BIMS
BLAST+
Expression Heatmap
GDRCyc
GIGWA (Explore Genotype Data)
JBrowse
MapViewer
Primer3
Sequence Retrieval
Synteny Viewer
View Pan-genome
Breeding Software Tools
Other Resources
General
About
Cite GDR
GDR Citations
Newsletters
GDR Email Archive
News Archives
People
Presentations
Steering Committee
Usage
Work Completed
Work in Progress
Help
Contact
User Manual
GDR Video Tutorials
Gene Naming Guideline
Genome Naming Guideline
Community
Conferences
Employment
Mailing Lists
Mailing List Archives
RosIGI
USRosExec
Community Projects
Search form
Search
Login
Display Syntenic Blocks
Block ID
mdriaB027
Organism A
Apple
Location A
Chr09_GDDH13v1.1 : 34167177 - 37589101
Organism B
Location B
HiC_scaffold_1_RIA_v1 : 15410592 - 19703795
Gene A
Gene B
e-value
MD09G1267400
g3172.t1
3e-87
MD09G1267500
NA
NA
MD09G1267600
NA
NA
MD09G1267700
NA
NA
MD09G1267800
NA
NA
MD09G1267900
NA
NA
MD09G1268100
NA
NA
MD09G1268200
NA
NA
MD09G1268300
NA
NA
MD09G1268600
NA
NA
MD09G1268700
NA
NA
MD09G1268800
NA
NA
NA
g3170.t1
NA
NA
g3169.t1
NA
NA
g3166.t1
NA
MD09G1268900
g3165.t1
0
MD09G1269000
g3164.t1
9e-48
MD09G1269100
g3163.t1
5e-53
MD09G1269200
NA
NA
MD09G1269400
NA
NA
MD09G1269600
NA
NA
MD09G1269700
NA
NA
MD09G1269800
NA
NA
MD09G1269900
NA
NA
MD09G1270000
g3161.t1
0
MD09G1270100
NA
NA
MD09G1270300
NA
NA
MD09G1270500
NA
NA
MD09G1270600
NA
NA
MD09G1270700
NA
NA
MD09G1270800
NA
NA
MD09G1270900
NA
NA
MD09G1271000
NA
NA
NA
g3160.t1
NA
NA
g3158.t1
NA
NA
g3157.t1
NA
NA
g3155.t1
NA
NA
g3153.t1
NA
NA
g3149.t1
NA
NA
g3148.t1
NA
MD09G1271100
g3147.t1
7e-43
NA
g3146.t1
NA
MD09G1271200
g3145.t1
0
MD09G1271300
g3139.t1
2e-99
MD09G1271400
g3138.t1
2e-124
MD09G1272000
NA
NA
MD09G1272400
NA
NA
MD09G1272500
NA
NA
MD09G1272800
NA
NA
MD09G1273300
NA
NA
MD09G1273500
NA
NA
MD09G1273700
NA
NA
MD09G1274000
NA
NA
MD09G1274100
NA
NA
MD09G1274200
NA
NA
MD09G1274400
NA
NA
NA
g3135.t1
NA
NA
g3130.t1
NA
NA
g3129.t1
NA
NA
g3127.t1
NA
NA
g3120.t1
NA
NA
g3119.t1
NA
NA
g3118.t1
NA
NA
g3112.t1
NA
NA
g3107.t1
NA
MD09G1274700
g3088.t1
0
MD09G1274800
NA
NA
MD09G1274900
NA
NA
MD09G1275000
NA
NA
MD09G1275400
NA
NA
MD09G1275500
NA
NA
MD09G1275700
NA
NA
NA
g3087.t1
NA
MD09G1275900
g3081.t1
0
MD09G1276000
NA
NA
MD09G1276200
g3076.t1
6e-86
MD09G1276300
g3074.t1
0
NA
g3071.t1
NA
NA
g3069.t1
NA
NA
g3067.t1
NA
NA
g3065.t1
NA
NA
g3062.t1
NA
NA
g3061.t1
NA
MD09G1276900
g3060.t1
0
MD09G1277000
NA
NA
MD09G1277300
NA
NA
NA
g3058.t1
NA
NA
g3056.t1
NA
NA
g3054.t1
NA
NA
g3053.t1
NA
MD09G1277400
g3051.t1
0
MD09G1277500
g3048.t1
0
MD09G1277600
NA
NA
MD09G1277700
NA
NA
MD09G1277800
NA
NA
MD09G1277900
NA
NA
MD09G1278000
NA
NA
MD09G1278100
NA
NA
MD09G1278200
NA
NA
MD09G1278300
g3047.t1
0
MD09G1278400
NA
NA
MD09G1278600
NA
NA
MD09G1278700
NA
NA
MD09G1278800
NA
NA
MD09G1278900
NA
NA
MD09G1279000
NA
NA
MD09G1279100
NA
NA
MD09G1279200
NA
NA
NA
g3046.t1
NA
NA
g3045.t1
NA
MD09G1279300
g3044.t1
3e-172
MD09G1279500
g3043.t1
5e-154
NA
g3040.t1
NA
MD09G1279600
g3039.t1
0
MD09G1279700
NA
NA
MD09G1279800
g3030.t1
0
MD09G1279900
g3029.t1
0
NA
g3028.t1
NA
MD09G1280100
g3027.t1
2e-178
NA
g3026.t1
NA
NA
g3021.t1
NA
NA
g3020.t1
NA
NA
g3017.t1
NA
MD09G1280200
g3016.t1
0
NA
g3014.t1
NA
NA
g3013.t1
NA
MD09G1280300
g3012.t1
0
NA
g3010.t1
NA
MD09G1280400
g3009.t1
0
MD09G1280600
NA
NA
MD09G1280700
NA
NA
MD09G1281000
NA
NA
MD09G1281100
NA
NA
MD09G1281200
NA
NA
NA
g3004.t1
NA
NA
g3000.t1
NA
NA
g2998.t1
NA
NA
g2990.t1
NA
NA
g2980.t1
NA
NA
g2976.t1
NA
NA
g2975.t1
NA
MD09G1281300
g2967.t1
0
NA
g2966.t1
NA
NA
g2965.t1
NA
NA
g2964.t1
NA
NA
g2963.t1
NA
NA
g2961.t1
NA
MD09G1281400
g2960.t1
0
NA
g2958.t1
NA
NA
g2957.t1
NA
NA
g2956.t1
NA
NA
g2955.t1
NA
NA
g2952.t1
NA
MD09G1281500
g2951.t1
0
MD09G1281600
NA
NA
MD09G1281700
NA
NA
MD09G1281900
g2950.t1
2e-123
MD09G1282000
g2949.t1
2e-57
MD09G1282100
NA
NA
NA
g2947.t1
NA
NA
g2946.t1
NA
MD09G1282200
g2942.t1
0
MD09G1282400
NA
NA
MD09G1282500
NA
NA
NA
g2941.t1
NA
NA
g2940.t1
NA
NA
g2939.t1
NA
NA
g2937.t1
NA
NA
g2931.t1
NA
NA
g2929.t1
NA
MD09G1282600
g2927.t1
4e-46
MD09G1282900
g2925.t1
3e-100
MD09G1283000
NA
NA
MD09G1283100
NA
NA
NA
g2924.t1
NA
MD09G1283200
g2923.t1
0
NA
g2919.t1
NA
NA
g2916.t1
NA
NA
g2915.t1
NA
NA
g2909.t1
NA
NA
g2908.t1
NA
NA
g2907.t1
NA
MD09G1283400
g2899.t1
0
MD09G1283600
NA
NA
MD09G1283700
NA
NA
MD09G1283800
NA
NA
MD09G1283900
g2898.t1
2e-79
MD09G1284000
g2897.t1
0
MD09G1284100
NA
NA
MD09G1284200
NA
NA
NA
g2896.t1
NA
MD09G1284300
g2895.t1
0
MD09G1284400
g2892.t1
0
MD09G1284800
NA
NA
NA
g2891.t1
NA
NA
g2890.t1
NA
MD09G1285000
g2882.t1
3e-60
MD09G1285100
g2881.t1
0
NA
g2876.t1
NA
MD09G1285300
g2875.t1
4e-34
MD09G1285400
NA
NA
NA
g2873.t1
NA
NA
g2872.t1
NA
NA
g2871.t1
NA
MD09G1285500
g2869.t1
8e-144
MD09G1285600
g2868.t1
0
NA
g2867.t1
NA
NA
g2862.t1
NA
MD09G1285700
g2861.t1
1e-68
MD09G1285800
g2860.t1
0
NA
g2857.t1
NA
MD09G1285900
g2856.t1
0
NA
g2853.t1
NA
NA
g2852.t1
NA
NA
g2851.t1
NA
MD09G1286000
g2846.t1
0
NA
g2845.t1
NA
NA
g2844.t1
NA
MD09G1286100
g2843.t1
0
NA
g2834.t1
NA
MD09G1286400
g2833.t1
0
MD09G1286500
NA
NA
MD09G1286600
g2831.t1
3e-70
MD09G1286700
g2830.t1
2e-90
MD09G1286800
g2828.t1
1e-123
NA
g2825.t1
NA
MD09G1286900
g2823.t1
8e-102
MD09G1287000
g2822.t1
7e-120
MD09G1287100
g2821.t1
0
MD09G1287200
g2818.t1
0
MD09G1287300
g2817.t1
0
MD09G1287400
NA
NA
NA
g2812.t1
NA
NA
g2809.t1
NA
MD09G1287700
g2805.t1
0
MD09G1287800
g2803.t1
1e-62
MD09G1287900
g2802.t1
2e-47
MD09G1288000
NA
NA
NA
g2801.t1
NA
NA
g2795.t1
NA
NA
g2786.t1
NA
NA
g2779.t1
NA
NA
g2778.t1
NA
NA
g2777.t1
NA
NA
g2776.t1
NA
NA
g2774.t1
NA
MD09G1288100
g2773.t1
1e-158
MD09G1288200
NA
NA
MD09G1288500
NA
NA
NA
g2772.t1
NA
NA
g2766.t1
NA
NA
g2763.t1
NA
NA
g2754.t1
NA
NA
g2753.t1
NA
NA
g2750.t1
NA
NA
g2748.t1
NA
NA
g2747.t1
NA
MD09G1288800
g2746.t1
2e-65
NA
g2745.t1
NA
NA
g2744.t1
NA
NA
g2735.t1
NA
NA
g2734.t1
NA
NA
g2732.t1
NA
NA
g2731.t1
NA
NA
g2730.t1
NA
NA
g2728.t1
NA
NA
g2727.t1
NA
NA
g2726.t1
NA
NA
g2724.t1
NA
NA
g2722.t1
NA
NA
g2721.t1
NA
MD09G1288900
g2720.t1
4e-50
MD09G1289100
NA
NA
MD09G1289200
NA
NA
MD09G1289400
g2719.t1
7e-162
MD09G1289500
g2718.t1
1e-171
MD09G1289800
NA
NA
MD09G1289900
NA
NA
NA
g2713.t1
NA
NA
g2707.t1
NA
MD09G1290100
g2706.t1
0
NA
g2705.t1
NA
MD09G1290300
g2704.t1
0
NA
g2703.t1
NA
MD09G1290400
g2702.t1
6e-31
MD09G1290500
g2701.t1
0
MD09G1290600
NA
NA
NA
g2700.t1
NA
NA
g2698.t1
NA
NA
g2695.t1
NA
NA
g2694.t1
NA
MD09G1290800
g2690.t1
6e-50
MD09G1290900
NA
NA
MD09G1291100
NA
NA
MD09G1291200
g2688.t1
0
NA
g2687.t1
NA
NA
g2686.t1
NA
NA
g2685.t1
NA
NA
g2684.t1
NA
NA
g2683.t1
NA
NA
g2682.t1
NA
NA
g2680.t1
NA
NA
g2679.t1
NA
NA
g2678.t1
NA
MD09G1291300
g2677.t1
0
NA
g2676.t1
NA
NA
g2675.t1
NA
MD09G1291400
g2673.t1
0
NA
g2668.t1
NA
NA
g2667.t1
NA
NA
g2666.t1
NA
NA
g2665.t1
NA
MD09G1291500
g2664.t1
0
MD09G1291600
g2663.t1
0
MD09G1291700
g2662.t1
3e-162
NA
g2661.t1
NA
MD09G1291800
g2660.t1
3e-94
NA
g2659.t1
NA
NA
g2657.t1
NA
NA
g2653.t1
NA
NA
g2649.t1
NA
NA
g2643.t1
NA
NA
g2640.t1
NA
NA
g2636.t1
NA
NA
g2632.t1
NA
NA
g2628.t1
NA
NA
g2627.t1
NA
NA
g2626.t1
NA
MD09G1291900
g2625.t1
1e-55
MD09G1292000
NA
NA
MD09G1292100
NA
NA
MD09G1292300
NA
NA
MD09G1292400
NA
NA
MD09G1292500
NA
NA
MD09G1292700
NA
NA
MD09G1292800
NA
NA
MD09G1292900
NA
NA
MD09G1293000
NA
NA
MD09G1293100
NA
NA
MD09G1293200
NA
NA
NA
g2620.t1
NA
NA
g2618.t1
NA
NA
g2617.t1
NA
NA
g2616.t1
NA
NA
g2611.t1
NA
NA
g2610.t1
NA
MD09G1293300
g2607.t1
3e-113