MDP0000294286, MDP0000294286 (mRNA) Malus spp. (apple)

Transcript Overview


Name	MDP0000294286
Unique Name	MDP0000294286
Type	mRNA
Organism	Malus x domestica (Apple)
Sequence length	11679

Alignments

The following features are aligned


Feature Name	Type	Location	Analysis	Reference
chr17	chromosome	chr17:21298151..21309829 -	Malus x domestica Whole Genome v1.0 Assembly & Annotation	n/a
MDC013217.297	contig	MDC013217.297:3461..15139 -	Malus x domestica Whole Genome v1.0 Assembly & Annotation	n/a

Analyses

This mRNA is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Malus x domestica Whole Genome v1.0 Assembly & Annotation	2012-07-26
InterProScan of Malus x domestica Whole Genome v1.0 mRNA	2012-07-23

Relationships

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MDP0000294286_exon_1	MDP0000294286_exon_1	Malus x domestica	CDS
MDP0000294286_exon_2	MDP0000294286_exon_2	Malus x domestica	CDS
MDP0000294286_exon_3	MDP0000294286_exon_3	Malus x domestica	CDS
MDP0000294286_exon_4	MDP0000294286_exon_4	Malus x domestica	CDS

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MDP0000294286	MDP0000294286	Malus x domestica	polypeptide

InterPro

Analysis Name: InterProScan of Malus x domestica Whole Genome v1.0 mRNA
Date Performed: 2012-07-23


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR006527	F-box associated domain, type 1	PFAM	PF07734	FBA_1	coord: 240..328 score: 9.8
IPR017451	F-box associated interaction domain	TIGRFAMs	TIGR01640	F_box_assoc_1: F-box protein interaction domain	coord: 122..330 score: 4.3
None	No IPR available	SEG	seg	seg	coord: 149..160 score
None	No IPR available	SEG	seg	seg	coord: 17..31 score
None	No IPR available	SEG	seg	seg	coord: 40..54 score
None	No IPR available	SEG	seg	seg	coord: 5..13 score

Sequences

The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence
protein sequence
mRNA from alignment at chr17:21298151..21309829-
mRNA from alignment at MDC013217.297:3461..15139-
coding sequence from alignment at MDC013217.297:3461..15139-

mRNA sequence

>MDP0000294286 ID=MDP0000294286; Name=MDP0000294286; organism=Malus x domestica; type=mRNA; length=11679bp
ATGTCTCAGGTGCATGAAAATGAAACTCTTGAAGATAGGGTGGTCGAAAT
CCTATCCAGGTTGTTGCCCAAATCTCTGATGCGATTCAAATGCATACGCA
AGTCTTGGTGCACTCTCATCAATAGTCCAAGTTTTGTGGCCAAACAGCTC
AGCAATTCTGTGGACAACAAATTCTCATCCTCCACTTGTATCCTTCTCAA
CCGTTCTCAGACTCATGTTTTCCCAGACAATAGTTGGAAACAAGAAGTTT
TCTGGTCCATGATCAATMTTTCTATTGATAGTGATGAGCACAACCTTCAT
TATGATGTTGAGGACCTAAATATACCATTTCCGCTGGAAGATCAKGATTA
CGTATTGATTCTCGGTTATTGCAATGGGATTGTTTGTGTAWCAGCAGGTA
AAAATATTCTTTTATGCAATCCTACAACGAGGGAATTCATGCGACTTCCC
AGTTCATGCCTTCTTCTACCTTCCCRTCCCAAGGGAAAATTCGAATTGGA
AACGGTCTTTCGAGCATTAGGATTTGGCTATGATTGCAAAGCTAAAGAAT
ACAAGGTAGTGCAAATTATAGAAAATTCTGAGTATTCAGATGATGAGCGA
ACATATTATCATCGTATTCCTCTTCCTCACACGGCTGAGGTATACACAAC
GGCTGCTAACTCTTGGAGAGAGATCAAGATTGATATATCAACTAAAACTT
ATTCCTGTTCTTGTCAAGTGTACTTGAAGGGATTTTGTTATTGGTATGCA
ACGGATGCTGAGGAATACATACTTTCATTTGATTTAGGTGATGAGATATT
TCATAGAATACAATTGCCTTCTAGAAGAGAATCCGGTTTTAAGTTTTATT
ATATCTTTCTTCGTAATGAATCCCTTGCTTCGTTTTGCTCTCGTTACGAT
CGAAGTGATAAGTCTGAATCATGTGAAATATGGGTAATGCACGACTATGA
TGGAGTAAAGAGTTCATGGACAAAACTACTAATCATTGGACCCTTACAAG
CCATTGGRAAGCCATTGACATTTTGGAAAAGTGACGAGCTTCTTATGCTT
GCCTCTGATGGAAGAGCCACCTCWTATAATTCTAGTACTGRAAWTCTCAA
ATATCTTCATATTCCTCCTATTCTCAATAGGGTTGTAGATTTCSAAGCTC
TTATKTATGTGAAAAGTATTGTTTCATTCAAGTGAGTTGAGTGCAAAGTT
CCATTTCCTCATATTTAATTTGTATTCATGATATAAGGCTTGCGTTTGCA
TCTTTTAATTTAATTGCTTTGTGTCCTTTGYACTATTTTGTAATGTTATT
CGATTTGGAAGTGTATGAAAACTATTTTCTTTRGAGTTAATTAATAATAA
CAATTCACATTTTTTTGACTCATTTAACATAACAAAGTTAAACCTTCCAG
CGTAGAAGTGCAAACTTTTATAAGTAAAATTCAGGATTCTAAAAAAAAAT
TACGCAAAATATTTATAGCCTTTTAGCCCCTAATCGTAGTTTGTAAAATA
CGGAATAGCTATAGTATGTGAAAGATACGTACGTATATTATTCGACAACT
TTTCTAAACATTACTTTGAAAAATTCAGCCACTTTTTTTTTTAATTTTAA
TATTTATGTATTTATTTTAATTAATTAAATAATTATATTAAGTTAAGAAT
ACGTGTTGACTATGTGAATTATATGTATTATTAAAAAAATGTGTGACAAT
AACTGGTATTAAACATTAAAAATACGTATTTACATGTATAAAACTTGTAT
TGTACGTTTGACTTTTAAAAAAAAACGTGCAATTTAACAAAACATTAAAA
TGTGTATAGAAAATAGAAGTATTTTTTTCAAAATWCGTAAATTCGTGTAT
AATATGTGATTTTACTAACTATGCCCGTAACCTCTCATCAATAAAACAAC
AAAAATTAAGAAACTAGATTTCATGTGAAGTATCATTTTGAGCARCAAGA
AGTGACACGCATTTTWTGATTTCATAATTTTAAAATCATCAAGGAAAATA
ATGAGTGTATCCACCATGTAGTATTACTGCACTAAGGTGTGAGAAAACGA
AGAAATGACCCACATGAAATGTTTAGCAATGGACYAAGTCTCCYWTATCG
AATTGATTTTTAGATTAAAACTCAACCCTAAAGCCTTAATAAGAAATTGT
TGTTGCAAATAGCAATAGTTATAATTGCCGTTTTAGCCAAAAATGATCTA
TGAGATTGATATAACTCATCACTTTAGTCACTAATAATGAAAACCGATAA
AACTGGTYCCTGAGTTTATCCACCAYAAATCATTTTGGTTCACTCGCAAA
AAATCTATCRATATCCTYGTTAAATTGTCATGTGAACAACTACGTGACCA
CCWTTTTAAGGGTATTTTTGTCAAATGGACCACTCGACTTGATGAGGATA
TTGACGAATTTTTCATGGAAAAACTAAAATGATTTACAGCGGTCGAACTC
AGGGCCACTTSTATCGATTTTTATAATCAGGGATTAAAGTGAGGAGYTAT
GTCATTCTCAAGATCATTTGGCCAAAAAGCCTTGTAAATTTCAAAAGTTT
TGTGGCGTATTTTATACGAGAGAGAGAAAGGGTGCGGCATCAGTAGAGAG
GGGAGAAATTGTAGAATGCTTTGCGATTTTGTGATTCTCTCTATGGCAGT
GCCTYTATTTATAGTAAACCAAGAGGAGAGGATTAACTTGTCCTCCAAGT
AAGTACAATCCTATAGGGAAAGAATYKCTAGAATAATGGATAATCTAGAA
TCCAAATCTAACTAGAATTCACTCAGTCACGTACTAAATATTCATAACAT
TTCCCYGTGAGTGTGTAAATACTCAAGTTGATGTAACATAAGGTTCGACA
AAGTTGGGGAAGTTGCCTCGTYAGTATTGATCYAAGAACACATTAGTCTC
AAACAGGGAACTTCCTATTGAAAAAAGTCTCACAWAATCCTATTATGGTA
AAACCCAATATGGGCCAAAAAACCATATATARTMTGAGGAAAATGGTGAG
TTGGATGCAAAGCCMATTTAAACACCTAYGAGACTTACATAAGGGTAACA
CCAGCCCAGGATAGGTGCCTCGTAAAAGCCTAGTCAGGTAGCATAAACTC
AAAGGAAAAAATGCTCCTAACTGTAAAGACAAYAGTAAATTAAGGCCAAG
TGAGTATACTTCRGGATTGTCTCCCTGAGTTTGACATAATTCCAAAAAAG
CTAACAAKGTTACAACTCRTAAAGTTTACGCATACCAATTCCTTGAACAR
GCTTTTGGAAAGTAGACTTCAGTAGTGACTTGGCAGAAAGTAAACTTCAG
CAGCGACTTGGTGGAAAGTARACTTCAGCARTGATTTGCTTAACCTCAAA
GCTCTTATGCTYTTGTTGTAGATGATARAAAAAGAATTTTGGGTCAATGT
GTTTGGTGTTGTCTTCTTTGATGTATCCCTTCTTGAGCTATATAATACAT
GTTATGTTATCTTCATAGCTTGCTGTAGAGACGTYAACGATGAAATAAAG
YCTACAGGTACTTCGAATATGTTCAATAACTATTCTTAACCAAAAGCACT
CYYGATTGGCTTCATAGAGGGTGATTATCTCAACATGGTTCTYAGTAGGT
TGCAACTAAGGTCGGTTTGGTGTGTCTCCGATGGTAAATTTGTTATCCGT
TTGAGAACGTGTGTTATGCGGTTAGACAAGTACCCTGCATCAGCATAACC
AATAAGGCAAGAATTAACCCAAGAACTGAGAAGGCAACAKCTCCACTCAA
TAATTTCTAGRGATARAACAACTCAAACCCATCGTACCTTTGATGTAGTG
GAAGATGTCTTTAAGACTTGTYTAGTGTCTGCGTGTAGGTTCATTGTTGT
ATCTCAYTAAAAGATCCATGGCAAAGGAGATGTTTGGTCTAGTGCACTGA
GCTATGTATAATAATGTGCCAATTGTACTAAGGTAAGGAACTTCTGGTTC
TAAGCCCTCTTCATCATCGTCCTTAGGACAAGAAARATCTTGTTTTGCAT
CTAGCAKTCGAACAAYCATATAGGTACTTGAAAGCTTCACTTTATCCTTA
TTAAAATGATGAAACTCYTTCTAAATGTAGTTCTAYTGATGGATAAGAAT
ACCATTCGAAAAATGTTTGATCTCCAGGCTGAGACAGTATGACGATTTCC
CTAGATCCTTTATCTCAAATTMTGACTTCAAGTGCATGGCGGTTTTCTTG
AGCTCTCCTGGAGTCTTAATGAGATTCATGTCTTTGACATAAATTGCAAC
AATCGCAAATTCAGAATGTGWCTTCTCCATGAGCACGCTAGGGTGTAGTA
CGTTGTYCACGTATCCCGAACTAGTYGAATACTCRCTCAGACARTTATAC
CACATCCATCCGGATTGCTGCAATTCATTGAGTAAACGCCTCTAGAATTA
TTTAATCCAGTCAATGGAAGTCCTTCTAGAACTTTTATATAGATTTCTGT
ATCAAGATCTCCATAAAGATACACAATTACCACATCTATGRGCTACAYTA
ATAAGTGATAGGTGATAGGAAACATTATCACATCCATGAATGGTGAATAA
GTGATAAGATTTTTAYCACCTGCGCAAAAAAGGTTAAARACACCTGAAAT
ACTTGCAAGAGAAACMAGATTATTGTAGAATAGTTGGCCTAAGCAAGGTT
GTTCTCCACATGGATTATTTTAAATAAATTTATGCGAAACCAAATCTCAA
CTAATTACTTAGAACAAAGTTTTGGAAAAAGGAGATTTAATGGCCTAAAT
TAAGAAAAATGAATTTAATTAAAAGGGTTAGCAAAAATYTGCAATATTAA
AGAAGGRRASAGAGAGRGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAAAGAGAGAGAGAGAATTTT
TGAAATAAAGTGAGAATGCACTAGGGTTCCGCCGTCACYTTAACAATCCT
ATGTAGTTCTTTCAATTACTATGAATTACATATGCATATTTGAAGGTTAG
ATTTTTCTAATATATGTCMTACTTGGAACCTCCAACATTTGACGTATATC
TAACATGCAACTCGTTTGTAGYGTCCAGATTGAATGTGAATRTGCAAGAC
TYATTACATTTTGTGAAAACTTGCTTTGAAAGAAATGAGTAGTTTCTATA
AAATGCAACCGAGGCATTGAAGAAAACGACCCTCRACTCATCTTACAAAA
AAAAAACTTTTAAAGGSTCTGCAACCTACTTTCCAATTATTCCCTTTGTA
GTTCAAACACTCCCTTGYATTCATAGCTCTGCTACTCCCCTTTATAGTAT
CAATTTCATGTACTAAATTTCATTGTCAGACTAATCCCTATACCTGYAAG
AACTTGCTTGACATACATGTGAACTTGCCCGAATAGGTTTAGTACTRGTT
TGGTATTGAAGTGCTTTTATAAAAAGTGGGTATAAAAAAAGYTGAGCTCA
AAACGGAGTTTGGTAAACACTTAAAAATAGTTTATTTTCACAATTTTGAG
TGAAAAAAGCTGAAAACGTGAAGCAGCAAAAAATRAGCTTATTCTCAYAG
CACATCARAAACAGTTTTTTTTYCAACGCACAACAATACCAAACCAGCCC
TTAAACTTTGCCTGGTTGCTTGTACTTATCAATTAATTTAAATTTGTTAT
CATTTCACGTTATTTAGTGTCCTTTTGTTAACATTTCATGAGTATTCGTA
AAGCATTTTTCTTTCATTTTCATTTACACTCTACTTTGTTCTCTATCTTT
ACTTTTTCTTACAAAGATTGCAAAATTGCTTGCATCATCTTTGATCAATT
TGGGCACCTCCACACTAGATGATACGACTTTTGATAGTGGTGGAAGCTCC
TCAATCTTAGGTCTCCATCTATTCGCTTCTTATACCTGACAAGAATCAAA
GATAGTAGCGATTTCAGTTAGTTTAGGATCATTAGGATCATTTTGTGCAT
CGTGATTCAAAAGAAAAWTTTCTAAATCATCCTCAATTCGACTCCTCTCA
AACTGTCCATTCATTGCAGTCAAAATAAAATTTACAACCTTGCATTCGCC
ATCTCCACATGGTTGCCTAAAAACATTAAAAATGTTAACCTCCATTRTTA
TATTTACAAAACAAAGTTTCGTAATCCACTCCTACAACTTATGTTAGCAT
CATAGGTAGCTAAGAAATGAMATCCTGAAATTACAGGAATGTGATATTCA
GAGGCTAGAAACAGGTGCAGTATCTAAAACAATAAAATSAAYGGGATAGT
AAAACTTGTCTACTTGGACTAACACATCCTCAATAACCCCTCTTAGGGTT
TTAATAGAATGATTAGCCAGCTGCAATTTTACCCGTATCGGCTTTAATTG
ACCAAGACCTAGCTGCAAATACAGACTAGCACCTAAGTCAAATAAAGCAT
GATCAACAAAATTATTTCCAATGACACAAGACAAAGTAGGACTTCCCRGG
TCTTYGTATTTTTGGGGGATTTATTTTGCAATGTACTACATTCACATAGG
CAGCTAAAAACGTAGTTTTCTTCACATTATGRTTTCTCTTATAAATAAAT
CTTTCGAAAATTTAGCATAAGCAKGAACCTGCTTAATAGCATCTAACAAA
AGAATATTTATCTTAACTTGCCTAAAAAGCTMAAAAATATYAGAGTTATA
AACAGCTTTGTTKAAGGGYTGTAAAGCTTTCGGAAAATATATAGGCACAT
GATATTCCTTGTCATTTTCARATTCTTTGAGCTTGTCAAGTTTATCATTA
STCTTGGTTTTCTCAACCTCCTCAGGTAAAGATGTTGTGTCAATTATTTA
CCGCTCCWAAGAGTAATCAYAGACATAGCATGCTCAAATTCGATCTTAAT
TGAATTAACATCKTTAGGATTAGCTTAAGTGTTTGCAGGGAATTTTCCTT
TTTCATTAACCGACATAGAGTTTGTTAATTTTGAAAGTTGACTAAATAAT
GAATCAAACTTTTGATCYAATACTTGAAGGGGATCTACATATGATTGTTT
ATGTTGAAACAAATTAGAAGCAGAATATTGGTGGTTAGGAGCACTTGCCT
GAGGGTACAATGTTGGAAATATGCCCTGAAAGTCAATCTTTGGAAGAAAC
CTTTCAGGACAATTGAATCGATGTATGGATGACTCTTATACATCAAAATG
GCAAAGATACTAATTAGGACTATCTCAATAAACGATATATGTCCTAAATA
GTGTATCCATGGACAATGGATCGATTGAAGAAGTAATCTAATGATGTTAG
ACTACAGAGACCTTCTTCACATAACCAAATGTCCAAAAAGGTTCCTGGTC
ATTGGATTGTCGGAGGGATACTGACAATGCGTAGACCGGTACATACTGTG
TCCGCTTCAATTGGAAGGATGGAAAGTCTCATCCCATTCGTGTTGTGATA
CTAAGACAAGTATGTAGGTGCTCATTAAGGGAATGAGTTCACTGAACACA
ATCGAACGAGAGTACTTGCATGGAGGTCTACTCACATGTCAAGCAAGTAA
CTCTAATGGTTGGAATAGTGTAAGTAGTCCTTTGACCTGAGGCATCGTCG
TTGTCTTGTGGTTAAGTACTTGATCTTTGATTATGTCAAAAGTCACTCTA
TCAGAATGTCAACGACATAGTTGGGGTTAAGCCACTTAGTCATGAAGGCA
AGTGTATGCGCAACAAGGAATCTCTAATCCTCGATAAGAGAGGAAGAATA
CTCTAAGATATGATTCGGGAATCTTTGGCCGAAGTATCGAGCGTATTAAA
AGGAAAGCGTTCCTATACGACTCAAATGAATCATATAAGAAGGAATAATC
ACATTAGGGGTTTGACATAATATATCCATACCCTAATGATGTGATTGAGA
GTATTGTTTTAGAGAATGATCGAATTACATTGTAATTCCAACTGAATAGG
TTCTCCGAATAAACTTCTACATTAGCTTGGGTAGCTATGACATATGGTTA
GATSTCACTCATAGCTTGTGAGTTCTTCTAGATGATTAAATGTAGTCRTC
AAAGAAGAAAGGTGAATTAAAATGAAGTTTKRATTCACTAAGTGATTGAA
TTAAATATAATCAATTGGATTGATGCCAATCACCTCACTGCCTTGCTAAT
TAGAACCTAAAAGATTGTTCACCAATACACTATTGTAGTGAGTAAYTAAT
GGATGATGGAAAYAATTAATTGGATTAATTAAGTGTTGTGATTAATTTAG
AAAGTCTAAAGAAATCATWAAAGCGATAAAGATCGTTTTGGGCTTAAAGA
AACGTTCGGGTTTAATTGGGCCCATTGGGCCTAAACCCATTGGGCTTTTA
TTCAAGCATTGGATGACTTGAAATAATAAAAGCCCAAAGCCCAAACCAAA
CACTAAAGGGCYGGCCATTTTAGGTGTGGAAAGGGTGAGATATTTAGTCA
AGTTGTTGGCTAGGTTTCTTTTGTCTATATAAGGAACTTTATAGAGATAT
TGTTCATTAGGGTTTTTTGTGTGTTTTWRAAACAACAAAGAGGYAAAAGA
AAGATAKCTCTCTAARAMCACAAAGGCCGGCCACCTWGRGGGTGTTTTAG
CTAACAATCTTTCACCCTTTTGGTTATTCCTTCATCCTTCTCACTACACT
AGTRGGTGAGGATCTTTAGAGGTTTCCTACTTTGGAAACTTGAAGAGAAC
CTAGGAGCACTCATTCTAWCAAAGTSGAGGAGGCAAGGAGGGAAGCTAGG
CTCAAGGAGTTCAAGGAACAAAGGGCTTGGAGGTGGTCCATCCTTGGTCT
CAAGTCTAGATCAAGAGGTATTAGACTAAAGCTTCTCTTTGTTCTTTTCT
CTAAAATTTTATTTGATGCATTATATATAAACCTATGAACCTTTGAAGGG
GATTTGCATGACTATAGCTTTGATAATTTGTTATAAATGCTTCCGCTGCT
TTCGTATATTAAATTTGATTTGTATATGCATGATAGTCATTTAGAAATCC
CTTACATGAATCTCATAGATTTCCCTTCATACAAGTCATTCCTCCAAAGT
AAATTTGGGTGATTTCTAGTTGCCGAATTGTATATCTTTGGGTGATTTCT
AGTAAAAACAATGCATGAAGGAGATGCAACACGAGTTGGATGCAATAGTC
TTTCAATGTTCTGGGGGGAGGGTTTTCCTTGCCTCCAATAACTGCATGGT
CACTAACACTATCAAAAAGATCCCCAAACAATGTTTCAATTTTAGGTTAT
GGACACTTACCAAATCTGCCACTTTGATCACGATATCACATGAAAATTTA
AGAACGAAGAAAAAAAAGGTAAAAATAAAAATAAGGGTTAATTTCAGTTT
ATTATCTTGAAGTTTCTTGGTTTTAAATATTTCATACATCAAGTTTTTTT
CGTCCAAGTCTGGTACCTAAAAACATAATTCTGGGATACTTTTATACATC
CATTAAGTTTTCCGTCAGAACATCCGTTAATTGATGATGTGGCACTTATG
TGGATAATGAATTGGCGCTACGTGTCAATATGGGCCTATGTGAATATTWA
WTTTTTTTTTTAAAAAATGTAAAATTTAAAATTAATAAAATTTAAAATAA
AAAGTAAAAATTTAAAATCAATTGGGTCATCTCGTCTCCCCCCTCCGCAC
CCAGTGCTCCCCGTTCCTAGAGTCAAATCCGAAGGTTTCAAGCACCTTCC
CAACCTCCTCTCGCCGACAGCAGCCACGAGCGCCTGCAATGTATCCACCA
CTCCAATAGATTTGAAATTTTGCAATCCACTCCAATCCAAGAAAAAGAGA
TAAAAAGATTGAACTGTTTCACCTCTGGGACGAAGATTGTCCGGCCCCGC
GAAGGAGGTCCATCCACTTGTTCTCGGCGATCAGACCTGMCTAATGCGGA
GGAGTTCCAGYGAAGGAAATTCGATGCATGGCTTCCTTGACTCGTGTCGC
ATTCTCCGCCTTCAGCGGTGCGTTTATACGATTCTCGYSMYTYTSMACKY
CYTMMTYATCTGMWTCGKMATCKCTSCTSCTATTTAAGCAACCATTGCGT
CCGACGTCTTAATTTAGCTGGAGAGACGAGATTCCTCTCTCGACCTGATT
CACAGTGACGTTGTTGGATTGCAGCTGAGAGTGGATCAGGACAGTGCTGT
TTCTGATCTGGTCTCCGTTTTCTTCGGAATCGACGGCGGAGACTGGGTGG
TAGAAATCGRSGGTGGAGGTTGGGAAGGTRCTTAAAACCTTCGGATTTGA
KGAGGAGGAACTTGGCGTCAGGGCTGCTATTCCGGGAACGGGGGGCACTA
GGTGCGGAGGAGGGAGACGTGAGACCCAGATTGATTTTYAATTTTTTTTT
ATTAATTATTAATTTTTTAATTTTTTAATATTCACGTGGGCCCATATTAA
CACRTGGCGTCCAGTTATTGTTCACATGGGRGCYAYGACATCAATTAACA
RAGGTTYAGATGGAAAATTTAACGGATGTTGCATCCATAAAATGGAGTTT
GAGATGATTGCCGTCATTGAYGCTCGAGAATATTGGATGGACAAAATCAT
CGACTACATACAAAGTGAAAAACTACTAGAGAACAGKAACCTGGCCAGAA
AGTGTSAAGATTTGGTTCTAAAAATCCCTGCCTATGCRCTAGGCACCTRG
CCACYGCTCGATTAGTCCTAGGTGTTTGAAAATTAAGAAAGTCGCCTAGA
TYCGCTTAGGCGTCCGCCTAGCTTGCCTAAACCCTCCTTGATCAYGACTC
TCACTTAGACATAGAATCAATAACTTTCATTTTGCATTTTATTTTTTAAA
TAAAATTTAAGAGACTTGTTGGATACTTGATGAACACTCATTATATGCTT
GTTYCTATGTTTTCAATATGTTCTAATACTTTATAATCTATWTATCATTT
TATTTTGTAAKTTTTGTATACAATTATGTGTTTTAAGTTTAAATAGGCAC
TTATTTATACAACATATAATAAATTTACTTAAATCCGCSTAGTCCACCTA
GGYGGTAAGTCCSTGCCCACTRCCTGACTARCGCCTAGCGTTTTTTAGAA
CCTTGGTCAAGATATACAGTCATCCGTGGAAARCTCTACCGACGCTCCTA
TTCTGAACCTTATACCTTATGCATCACTCTAGATGTTGGCCTACGAATTC
TAAATGAWATCCACYCGGGGGTCTGCGACAATCATGCTGGAGGAAGGTTG
TTGGATCGAAAAGTGATAATTSCAAGCTACTATTGGCCCACCATGAAGCA
AAAAGCAATTAGCATTGCCCAGAATTGCAATAACGTCCAAGGTACGCTCC
TATGAACCMTCAACATGCARAAGAACTTAATACTCTAATAGGTTCATGGC
CTTTCATGCAATGGGGCATCGATTTAGTAGGACTTCTTAAGAAARCACCA
GGGAATAGGCAATACCTGGCGATAGATTACTTCTCAAAATGGATAGAAGY
GGAGCCCTTAACAAGAATCATTATTGCAGTTGTAAAGTTCTTCGTTTGAA
AAAACATCATTTGCAAATTTGGAATTCCCTRCACAATATTGACAGAYAAC
RGGCTACAGTTYACCAGCTCTGAAGTCACAAATTGGTACAAAGAGCTAGG
ACCACCCTACAAAGAGCTCTCATATCAGTTCAAGTCACAACTATGCAGAA
TTTGCATACTRAAGARCGGACCRCCCTAGAAAATGTAGAGGTCCTGAACA
CTRATCTCAACTTTGCGGATGAGCWTTGA

protein sequence of MDP0000294286

>MDP0000294286 ID=MDP0000294286; Name=MDP0000294286; organism=Malus x domestica; type=polypeptide; length=542bp
MSQVHENETLEDRVVEILSRLLPKSLMRFKCIRKSWCTLINSPSFVAKQL
SNSVDNKFSSSTCILLNRSQTHVFPDNSWKQEVFWSMINXSIDSDEHNLH
YDVEDLNIPFPLEDXDYVLILGYCNGIVCVXAGKNILLCNPTTREFMRLP
SSCLLLPSXPKGKFELETVFRALGFGYDCKAKEYKVVQIIENSEYSDDER
TYYHRIPLPHTAEVYTTAANSWREIKIDISTKTYSCSCQVYLKGFCYWYA
TDAEEYILSFDLGDEIFHRIQLPSRRESGFKFYYIFLRNESLASFCSRYD
RSDKSESCEIWVMHDYDGVKSSWTKLLIIGPLQAIGKPLTFWKSDELLML
ASDGRATSYNSSTXXLKYLHIPPILNRVVDFXALXYVKIIRGKLYRRSYS
EPYTLCITLDVGLRILNXIHXGVCDNHAGGRLLDRKVIIXSYYWPTMKQK
AISIAQNCNNVQEELNTLIGSWPFMQWGIDLVGLLKKXPGNRQYLAIDYF
SKWIEXEPLTRIIIAVNLHTXERTXLENVEVLNTXLNFADEX

mRNA from alignment at chr17:21298151..21309829-

Legend: CDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>MDP0000294286 ID=MDP0000294286; Name=MDP0000294286; organism=Malus x domestica; type=mRNA; location=Sequence derived from: chr17:21298151..21309829- (Malus x domestica

mRNA from alignment at MDC013217.297:3461..15139-

Legend: CDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>MDP0000294286 ID=MDP0000294286; Name=MDP0000294286; organism=Malus x domestica; type=mRNA; length=11679bp; location=Sequence derived from: MDC013217.297:3461..15139- (Malus x domestica
ATGTCTCAGGTGCATGAAAATGAAACTCTTGAAGATAGGGTGGTCGAAAT
CCTATCCAGGTTGTTGCCCAAATCTCTGATGCGATTCAAATGCATACGCA
AGTCTTGGTGCACTCTCATCAATAGTCCAAGTTTTGTGGCCAAACAGCTC
AGCAATTCTGTGGACAACAAATTCTCATCCTCCACTTGTATCCTTCTCAA
CCGTTCTCAGACTCATGTTTTCCCAGACAATAGTTGGAAACAAGAAGTTT
TCTGGTCCATGATCAATMTTTCTATTGATAGTGATGAGCACAACCTTCAT
TATGATGTTGAGGACCTAAATATACCATTTCCGCTGGAAGATCAKGATTA
CGTATTGATTCTCGGTTATTGCAATGGGATTGTTTGTGTAWCAGCAGGTA
AAAATATTCTTTTATGCAATCCTACAACGAGGGAATTCATGCGACTTCCC
AGTTCATGCCTTCTTCTACCTTCCCRTCCCAAGGGAAAATTCGAATTGGA
AACGGTCTTTCGAGCATTAGGATTTGGCTATGATTGCAAAGCTAAAGAAT
ACAAGGTAGTGCAAATTATAGAAAATTCTGAGTATTCAGATGATGAGCGA
ACATATTATCATCGTATTCCTCTTCCTCACACGGCTGAGGTATACACAAC
GGCTGCTAACTCTTGGAGAGAGATCAAGATTGATATATCAACTAAAACTT
ATTCCTGTTCTTGTCAAGTGTACTTGAAGGGATTTTGTTATTGGTATGCA
ACGGATGCTGAGGAATACATACTTTCATTTGATTTAGGTGATGAGATATT
TCATAGAATACAATTGCCTTCTAGAAGAGAATCCGGTTTTAAGTTTTATT
ATATCTTTCTTCGTAATGAATCCCTTGCTTCGTTTTGCTCTCGTTACGAT
CGAAGTGATAAGTCTGAATCATGTGAAATATGGGTAATGCACGACTATGA
TGGAGTAAAGAGTTCATGGACAAAACTACTAATCATTGGACCCTTACAAG
CCATTGGRAAGCCATTGACATTTTGGAAAAGTGACGAGCTTCTTATGCTT
GCCTCTGATGGAAGAGCCACCTCWTATAATTCTAGTACTGRAAWTCTCAA
ATATCTTCATATTCCTCCTATTCTCAATAGGGTTGTAGATTTCSAAGCTC
TTATKTATGTGAAAAGTATTGTTTCATTCAAGTGAGTTGAGTGCAAAGTT
CCATTTCCTCATATTTAATTTGTATTCATGATATAAGGCTTGCGTTTGCA
TCTTTTAATTTAATTGCTTTGTGTCCTTTGYACTATTTTGTAATGTTATT
CGATTTGGAAGTGTATGAAAACTATTTTCTTTRGAGTTAATTAATAATAA
CAATTCACATTTTTTTGACTCATTTAACATAACAAAGTTAAACCTTCCAG
CGTAGAAGTGCAAACTTTTATAAGTAAAATTCAGGATTCTAAAAAAAAAT
TACGCAAAATATTTATAGCCTTTTAGCCCCTAATCGTAGTTTGTAAAATA
CGGAATAGCTATAGTATGTGAAAGATACGTACGTATATTATTCGACAACT
TTTCTAAACATTACTTTGAAAAATTCAGCCACTTTTTTTTTTAATTTTAA
TATTTATGTATTTATTTTAATTAATTAAATAATTATATTAAGTTAAGAAT
ACGTGTTGACTATGTGAATTATATGTATTATTAAAAAAATGTGTGACAAT
AACTGGTATTAAACATTAAAAATACGTATTTACATGTATAAAACTTGTAT
TGTACGTTTGACTTTTAAAAAAAAACGTGCAATTTAACAAAACATTAAAA
TGTGTATAGAAAATAGAAGTATTTTTTTCAAAATWCGTAAATTCGTGTAT
AATATGTGATTTTACTAACTATGCCCGTAACCTCTCATCAATAAAACAAC
AAAAATTAAGAAACTAGATTTCATGTGAAGTATCATTTTGAGCARCAAGA
AGTGACACGCATTTTWTGATTTCATAATTTTAAAATCATCAAGGAAAATA
ATGAGTGTATCCACCATGTAGTATTACTGCACTAAGGTGTGAGAAAACGA
AGAAATGACCCACATGAAATGTTTAGCAATGGACYAAGTCTCCYWTATCG
AATTGATTTTTAGATTAAAACTCAACCCTAAAGCCTTAATAAGAAATTGT
TGTTGCAAATAGCAATAGTTATAATTGCCGTTTTAGCCAAAAATGATCTA
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>MDP0000294286 ID=MDP0000294286; Name=MDP0000294286; organism=Malus x domestica; type=CDS; length=1629bp; location=Sequence derived from: MDC013217.297:3461..15139- (Malus x domestica
ATGTCTCAGGTGCATGAAAATGAAACTCTTGAAGATAGGGTGGTCGAAAT
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AGTCTTGGTGCACTCTCATCAATAGTCCAAGTTTTGTGGCCAAACAGCTC
AGCAATTCTGTGGACAACAAATTCTCATCCTCCACTTGTATCCTTCTCAA
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ACGGATGCTGAGGAATACATACTTTCATTTGATTTAGGTGATGAGATATT
TCATAGAATACAATTGCCTTCTAGAAGAGAATCCGGTTTTAAGTTTTATT
ATATCTTTCTTCGTAATGAATCCCTTGCTTCGTTTTGCTCTCGTTACGAT
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TGGAGTAAAGAGTTCATGGACAAAACTACTAATCATTGGACCCTTACAAG
CCATTGGRAAGCCATTGACATTTTGGAAAAGTGACGAGCTTCTTATGCTT
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Annotated Terms

The following terms have been associated with this mRNA:

Vocabulary: **INTERPRO**
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