MDP0000753788, MDP0000753788 (mRNA) Malus spp. (apple)

Transcript Overview


Name	MDP0000753788
Unique Name	MDP0000753788
Type	mRNA
Organism	Malus x domestica (Apple)
Sequence length	11092

Alignments

The following features are aligned


Feature Name	Type	Location	Analysis	Reference
chr5	chromosome	chr5:19237642..19248733 -	Malus x domestica Whole Genome v1.0 Assembly & Annotation	n/a
MDC000132.393	contig	MDC000132.393:3639..14730 -	Malus x domestica Whole Genome v1.0 Assembly & Annotation	n/a

Analyses

This mRNA is derived from or has results from the following analyses


Analysis Name	Date Performed
Malus x domestica Whole Genome v1.0 Assembly & Annotation	2012-07-26
InterProScan of Malus x domestica Whole Genome v1.0 mRNA	2012-07-23

Relationships

The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MDP0000753788_exon_1	MDP0000753788_exon_1	Malus x domestica	CDS
MDP0000753788_exon_2	MDP0000753788_exon_2	Malus x domestica	CDS
MDP0000753788_exon_3	MDP0000753788_exon_3	Malus x domestica	CDS
MDP0000753788_exon_4	MDP0000753788_exon_4	Malus x domestica	CDS
MDP0000753788_exon_5	MDP0000753788_exon_5	Malus x domestica	CDS
MDP0000753788_exon_6	MDP0000753788_exon_6	Malus x domestica	CDS
MDP0000753788_exon_7	MDP0000753788_exon_7	Malus x domestica	CDS
MDP0000753788_exon_8	MDP0000753788_exon_8	Malus x domestica	CDS

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MDP0000753788	MDP0000753788	Malus x domestica	polypeptide

InterPro

Analysis Name: InterProScan of Malus x domestica Whole Genome v1.0 mRNA
Date Performed: 2012-07-23


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR000589	Ribosomal protein S15	PFAM	PF00312	Ribosomal_S15	coord: 479..546 score: 1.5
IPR000589	Ribosomal protein S15	PROSITE	PS00362	RIBOSOMAL_S15	coord: 511..541 score
IPR009068	S15/NS1, RNA-binding	SUPERFAMILY	47060	S15/NS1 RNA-binding domain	coord: 478..553 score: 4.3
IPR012606	Ribosomal protein S13/S15, N-terminal	PFAM	PF08069	Ribosomal_S13_N	coord: 441..473 score: 2.2
IPR021131	Ribosomal protein L18e/L15P	PFAM	PF00828	Ribosomal_L18e	coord: 335..447 score: 2.6
IPR021131	Ribosomal protein L18e/L15P	SUPERFAMILY	52080	Ribosomal proteins L15p and L18e	coord: 346..414 score: 7.7
None	No IPR available	PANTHER	PTHR11885	FAMILY NOT NAMED	coord: 446..553 score: 9.4
None	No IPR available	SEG	seg	seg	coord: 119..127 score
None	No IPR available	SEG	seg	seg	coord: 18..27 score: NAcoord: 97..109 score
None	No IPR available	SEG	seg	seg	coord: 7..22 score: NAcoord: 34..46 score
None	No IPR available	SEG	seg	seg	coord: 11..24 score
None	No IPR available	SEG	seg	seg	coord: 37..49 score: NAcoord: 61..70 score
None	No IPR available	SEG	seg	seg	coord: 29..41 score

Sequences

The following sequences are available for this feature:

mRNA sequence
protein sequence
mRNA from alignment at chr5:19237642..19248733-
mRNA from alignment at MDC000132.393:3639..14730-
coding sequence from alignment at MDC000132.393:3639..14730-

mRNA sequence

>MDP0000753788 ID=MDP0000753788; Name=MDP0000753788; organism=Malus x domestica; type=mRNA; length=11092bp
ATGCGTGTGGACTCGCCCAAGCCCAGGCCAATCTCGGCCCAGTCACGCGC
TCAACTCGCCCCACGCGGGTTGACGCCTTCAGTGCTCGACAAGGTGGGGC
CCACTATCAAGGGAGATGTTGGCCACCATCATGAGCCCAACGGCTCTTTT
GTTCATCTGACGGCTGACATTTTTGGACCGTTGGTTGATCCAACGGTCCA
GATTCAAATTTTTTTTATTAAAATGTTATTTTAAAATACATTGAATCCAA
CGGCTGAGATCGAATATAAACAAATCTAACGGTAAAAAAAAATTATCTAA
CGGCCCAAATTTAAATCCAACGGCTAAAATAATTATAAAAAAAAAAWATA
TATATATATATATATATATATATATATATATAACTCAAAATTCACCAAAA
AAACTCTATGAATACCTATGTATTTGTTCAAACATCCACATAAAACTCAC
ATTTCTCCTACAATTATTCCAATTTTTCTTTCTACCATTTCTTCCCATTT
CCAAATTTTTCAAGATGCCAAGAGAGCATATTAGAGGTCGTAATTGGACC
TGTGAGGAAGATGTTGCTTTATGCTTGGCATGGGTTTCTGTTAGCGAAGA
TGGTGCAGTTGGCATGAATCAAAATAAAAAGGTTTTGTGGGATAAAATCA
TTGAAAAGTTTCATGAAAACTGCGACGACGGCGGGAGGGACGATGATGGT
GTCTACGATCGGTGGAAGACTATCAACAAAGCATGCACTTTATGGAAGGG
AAGCTTGGAGAGAGCCGTGGTTGGCATGGCTAGTGGAAGAAGCGCCGCGG
AAATTGTGAGTTTTTTTGTTGATATTTTATTTGTCATGTACATAATATTA
TTTTGCAACTAATTGTTTTTATGTATTTTTTGCATAGGGTGACAAAGGAA
TGGAAATTTACAAGACAAGAGTAACACCAAAAAAATCAAGTTTTTAAGTT
GCAACATGCTTGGGACGTCCTCAAGGATTTTCCGAGGTGGGGAACCGATG
CAGACCAACAATGGGGAAAATTATTTCAATGTGAAGCCGCACCAACAAAT
GTCATTGATGAAGGTGTCAATGAAGGTGTCGATGAAATGACCCCAACTCC
TTCTTTTGCAAGGCCCTCGGGAAGAGATAAACAAAAGGAGGGAAAGAGAA
AAGGGAAGTCCCAAGATCCAATGAGTGGACACATTGTGTTTCACATGTGT
TCTATGTGTTTCACATGTGTTTTGTATGTGTTTCGTGTGTGTCATGTGTT
TCACATGTGTTCTATGTGTGCTTCATCTCTATCATGTGTTTTGTATGTCC
TTCACATGTGTATGTGCTTCACATGTGTTCTGTGTGTGTCTTGTGTGTTT
TATGTATTTTGTGTTTATACATCTCTATCATGATTTTCATATTCTTCCAT
AGTGTTTCATGAGTTTCATGTATTGATTTAGTGATTTTTCAATATTTATC
GGAATTTAAATATTTTWAAATTAAAATGTTCATAAAATTAATTTACGATA
TAGTCTACATTATTTTTTTAAAGTAAATTTAAGAAAAAAWTWAGCCTAAA
TTCATTCTTTAATAATCTGGGTCTAAAATTTAGGCCAAAATGGTTGATGA
AGCAGAAAAGTTGTTTCTAGGCTAAAAGCTAAATTTTCTGGKTTAAAAAT
TTTGGTTTTTAGTCCAAGGGTTTGAGGAGAAAAATAGTTTCTGAGTTATG
RCTTAAAATTTTATGGCTTAAATTTTTAAGTTTTATCCCAAGGGTTGGAG
ATGGTCTAATAGAGGTAGGGTCCATCAACGCATGTGAGTCTTATCTTTAT
TAGAGAGATTATACAAATAGATGGTAAGAGTAGCATTTTTTAATTTTAAA
TTAATGAGTCTTGCAATTTTCTTCACTATATGGGTCCTATTAACACATTT
TGTTCAAGTAGTTCATTATTGTTTTTTCTTTGCTCTTTCAATAGTGCTCT
AATTTACATGAAAGAGAATTTGAACTCAGATGCATGGGGATTGCAGCATG
CACTCTGATAGGCAACTAACCTAATGTATTTATGCAAAAGAAAATGTATT
AGGACTTTCTTGTTTAACCTTCTCGCCTTCTTTTAGTATAGTTTAGAGAA
GAAATGTAGTTTGTATTGTATTTTACAACAACAACAACAACAACAAAAAA
TCTGTTTGAGTTGAGAAAAAATGTGTACGAAACTCTTTCAATTGATGAAT
TCATGATCCATGATTCACATTTATTTATTTGAGAAACTTACTATGGCCAC
ATTTCTTTTGCCTTTTTCTTCTGCCTTTAAATTGTAGGCAAAACATGTAA
ATGTGCTATCTATGTATCCATAAATACCGTATTCAAACTCCCTCTAAAAC
AAGTTTAAGTAGGACTTTGTAATATTTCTTTTTTATTGTATTCTAATGAA
TTAAGGTTACAACATAAATTTTAAAACAAAACTACGTTTAAGTGTCAACT
GTTTTGTAGAACGTCTAAATAGCGATCCTCATTAAACAAAACAGGGTTAA
AGTTGGCAATCAAGCAATGCCAAATGCCTATTTTAATGTGCATCTGTGAA
TAATTTTGTGTGCTTCTTAGAATACTAATTTTCTCTTAAAAAACTATAAT
AAGATCTGTTCGATTACTCTTGCAAAATACACTTGAGGACATAAATCTTT
TGCAACAATAGCTTAACTTGATGCACAAACAAACATTATGAAAATAATGT
GGTTAGTGAAAATTAGAAATAATAATTGGGAATAAGAAAAAATCTTATGT
GAAAAAGAAATTTAAAAGAAAGCAATCATGCCATCCCTTTTAAAGGATTT
ACATCCCATCCAGATCCTCTTTGTGATCTAGGATCCTCGCATTTTATCCG
TTTATTGTGCATCGTGCTGTCACCGAGTCTTTTTAATTGAAATTAAATAC
AAACAGTATCCAACAAAAATTAGATGCACGATGTACAATAAACAAATAAA
ATATAAGAACCCTATGTATTTTAAAAAAGAAGATCCAGAAAGTATCCTCA
TCCCCGTTTAAAATGGACCATGGTACAACTTTAAAGACAATGGTGGGATT
AGGGGAAAAGGCTAAAAGCTTAAAAGGTAAAAGCAAAGAAAGTATGGCAC
AAACAAGCATGGCAATACTTTGAATTCACTGTAGTCTCTGTCAATTAAGA
AAGGGAGTGAAGCGAGGCGAGCTGATAAATATCCGATATTGTTTCTCTCC
GCTGGTTCTCACTATGCTCCACTGTTTTCATTATTCATTCCAACACATGT
GACCGGTGTCCTTGGATAATGTTGTCACTCTTTGATATGTGTTGACAAAC
TACTGGTTTATATCACGCATCCGAACCATGATGTCTTGTTTATACTACAT
TAAATTTGTCAAATTATCAGAGAGATAGACCAAAGATCCACTTCCAAAGG
TCCATTTCTAATCACATCGATATTTTCCCCAACTTATTAATKATCACTTG
CACAATCTGACAGGTATAAAGTTTTATCATAAAACCTCTCAGTATTAGTT
GGAGTGAAATTATGATATTTAAACTCTTCTTTTTTCAAAAATACGGTCGA
TGTGGGATATTTCAACACACTCCCTCACTTGAAAGTTGGAACCCAATTTG
TGAGTCACATGTGGGAGATCCACACATCGACAACCACATGGAGCCAAGAG
AACTCTCCATACACGCGAGGCTAAGGGAACCCACCTATCACGTGGCAGTA
CATGCTAAGTACCCACACATCGACAACTGCTTAGAGCCAAGGGAACTCAT
CCTACAGTCGGGGTCAAGGGGACCCACCCATCACGTGGCACTATTGGTCC
ACTCTCCGGCTCTGATACCATGTCAAATTATCAGAGAGACAGGCCAAATG
TCCACTTCCAACCACACCGATAATGTYCCCAACTTGTTAATTACCACTTG
CACATTCGTTATGTGTGAGGTTTTATCACAAAAAAGGCTTCAGTGTTAGT
TGGAGTGAAGTTATGATATTTAAACTCTTTTTTTTTATTTTTTTTTTTGA
AATACAATCGATGTGGGAAATTTCAACAAAATTGAGTTAAAACAAGTTGC
CTGTTATGGAATAATTTTTCTCTTAAAGTTATACTCTCTTGGTTTGGTTA
TCAAACTTATATTGGTTGTGAGGTAAATACCCAGTACTAACTATGTGCTT
TGAATATCAATCTCTCAAAGCTCATGCAAATCCAAACCCAAGTACATAGA
TAATGGAGAATTCAAAAGACTTATTTATCAAAATGCTCTCAAATAATACA
TTAAGCATCACTTTACCCTATACTTTGTAACTAATTCGTCAACTTTGTCC
GTCCCTCATTAACTATTAAGTACGGATCATACTCAATAGTCATCTATATC
ATTGATATTATGTCGATATCGTGGAGCAAAAGATAATAGTTAAAGTCTTC
CATAAAAAAAGAGATAATAGTTAATAGACAAAGTTGATATATTTGTAATG
TATGATATGAAATGAAAACTCATCTACAACTGCAAAAGTAGAGATAAACA
TTGTAAAAGTGACTAAGATATGATAATGTACGTTGTACTCATTAAAAGAC
AAATCTAACTAAACATTAGCTTGGAAATGTTGAAGATGCTCGTAAACAGT
TAACCCAGAACGTTGGAAATATGGATCTAGCTATAACTCAGTAATTGAAG
TTCTAATACAGTAATACTTGAGGGCTTCTGCCAATGTTCCTCCTGTCCAA
TTCAAGTAGAACCTTGTATTCCTGCAGCTTGATAAACTTTTTTCTCTTTC
CTTTTCTTTTTCCCCATATACGCATAAATACATGATATATATCAAAACTG
ATACTGGATGTGACATCTGATCAGTGGTCAATGATACACAGGTTACATTA
ACATATTTACACAAACAGATATATATAGACCTATGGACCCATTAATTGTT
CTCTACAGCTTCATGCATGTGAACTCCCTTTTTCACCTGTGCATGCCATG
CACATGCAATACTCTTGCTACATAAATGAACATGTGAACTTAAACATTAT
TATTCCTTGTCTTTTATCTCCACCTCCAAGGGTAAAAAGTCGATTTCGCA
AATATTTTTCAGGTTGCATTTTATAGACTGTTCATTCAAAATATTAGCCA
AATTAGAAATATTTGAGACATCTAATTGAGTTTAAAAAAATTAAGAACAC
TTTGTTCTTTAAAATATATTGAAATTTCATCAAGATAATTAAATAGGCAA
ATGATTTCATATTGAATTGAATTTTTGCAAGAATGCATGATCTATGAATC
AAGATTTACAAAATAAATGATTTGAATTGTTGAAGTTCAATGTAAAGTGA
ATCTCACAACTAATCTATTTTTACCTAAAATGAGAATTCTTTTGAATAAA
GGACCTGTATATATATATATATATAGAGTTATGGACCCATTGTTCTTTAC
AGCTTCATGCATGTGAACTCTCTTTTTCATTTGTACATGTCATGCATGCA
AAACTTTGCTACACAAATGCACAACATGTGAACTTAAACATTATTATTCC
TTGTCTTTTTATCTCCAGCTCCTAGGGTAAAGATTCAGTCAATTTCGCGC
AGCTTCTTGTTAAGACACTTTTAATGAGTGTATATATATATATATATATA
TAATATAGAATGAGGACAGATTTACTCACAGACAGTCACTCAGTCACCAG
TCACCAATTCTGTTCTTTGTTTTGACCTTTCAATCATGTTGTTGTACTTT
TACCATATGCTTGGTAAAACATCAATACGGATCCTCGTCGAATCCTTTTT
GCAAGGATTTAGAATTTATGAATTATATTCGTTCATTGTATATCATGCAG
TCATTATTTTAAATTTTTTATTTAAAATAAAATACAAATAGTATCTCATA
ACAAACTGACCGTACAATATACCATAAACAGACACGATTCACAAATCTCC
ATGATCCTCACAACAAGGATCAAGAGAGGATCCTGTTGGGTAAAACACAT
CCCTCACATTTTGATTTTTGGGATGAGGATTTTAGGAATTCTTACCTTTT
ATCTGTTCATCGTACRTCATGAGRTCAATTTTCGTTAGATACTATTTATG
TTAATTTGAAATTAAAAAATTTGAAATAATTTGCAACCACACAATGTACA
ATAAATGAATAAGATGTGAAAATCTTTAAAATTCTTCGAATGGAATCCAA
ATACGATTTTTGAGAGCACCACAGATAATTGCAACTACCCAACTAGATAA
TGCCTTTCACCACAAATTAAGAAAAARKWAAAAAAWWCAGTTATAATTAA
AGAATGAGGATCCTCTCAGGATCCTCTTTATGAAGATCTCGAAGATCATC
CAATCACATCCATTCATCGTATATYGTGCGGTTAATTTTCGTCATGTATT
ATTTATATTTAATTATAAATAAAAAAAAWATACAATGATTTATGATAGAA
TRATATATGATGAACAAATGTAATTAAATTATTCTCAAAATCCTCATAAA
AAGAATCCAAAGAAATCCTCATTCATAATTAAATATTTATGCATAATATG
TGACATATTGTCATATATTGGTTACTAGAGCTGGCTCGTGATCGATCCAT
AGCTTTTCCTAGGCCACCTACTTCAATCGTAGGCTAACCTAAAATATCCC
AATACTAAGAAAGTACACGCACATCAACCTTTTGAGCTTTCCTAAATTTA
ATTGACTCTGGTTAATCTGTACCTAATACTCTAGATCAAATTATGACATT
GATTCTCCTACGTTGAGGAGATCATAGCGGATATGAGCGTTGATACTTGG
GTGAACAAACCCCCATCTTTGCTGGTTCATATCCTTAACAAAGATGGTTT
GTCATGCACTCCATTTGTATAGTGTTTTAATAGGTGTTTATGGGAGATGA
TTATGCTTTGTTACATCGTCTTTATCTTTATAACCCGTTTTCATCCTGTG
TATTTTGAGGAGTGGTTGGTTTCTCTCCTCTGTTAGTCYAATTGTGGACT
TTCTTTGTAAAATTGGCTTTTTGCCCTGGTTAATAATATAGCCACTTTAA
CCAAAAAAAATAAAAAATCCTCTGGATCAGAAATAAATATCTATACCTAG
TACTAAAGGTTGAACTTGTCTATCTATCAGTTACAGCTAACAGTGTTCGC
ACTAGATATATGGTGTAAATTTGCGTATATAATAGAAGAGTGAGATTCTT
TTTCACGATTATATTGAGGCAACATATAACCTATAATTTTTGTATTTGTT
TGACAAACGAAAATGATTAATTGACATATATAGAATGGTTTGATTCTCTT
CCACAACAAATCATGTACCAAGTCACATGCAGGCAGGGTCGGGTGATTTA
ACAACATTTTTAGCGTTAGGGAAGATTTTGATCATATTATTATATCTTGA
AAGTGACAAAATATTGAAATGGTAGTGATCTCTGCTCGTTCATGCTCATA
CAGTAAATATGCAAAAGGAAGAATGAGACGTGCGCACCTAGGGAAGATTT
TTTATTTTTTATTTGGAAACTAGGGAAGATTTTGATCAAATAAAATCTTT
AAAGTCACAAAAGATTGAAAGATGTTTTGAGGCCTTTTTTTTTTAAAGTA
AGACAATAGCGTTAATGAGTTAGATAGTTAATTATTAGGTGGTGGAGAAT
CGGTGAGCATCGAACCCACACAATTGTGCACAGACAAGATTGCTTTCCAC
ATTGGAGTAAAGTGTCATATGCAAATCTTAAAGCCTTTCTAATTTGGTAC
CTAAATATATATATATATATATATTAAATAAATTAGTGGAATTAGAAAAT
TTTCCAATCCATATTTACCAACCGTCTTCACACCATTATCAATTTAAGGC
ACATCATATTTGATTAAGAGATTAAAGATTTTTTTTTTAATTTTTCTTCT
TTTTTGCCAAGAATACATTGAATAAGAAAAATTTCAACACATATAAAAAA
GGGTTTGGCAAAAATATGAGACATGGTTTAGCCATTCAATACTTCAGTCT
GATGGTATTCATTTTCATTTGTAAGTGAGAGGTCTTAGGTTCGAATTTTG
TAGAGGACGGATTCAATACCATAGGTTGCCCTTTGTGTGGCTTAGCTGAG
CTCTCATTCCTCTTAGTATAAAAATATATMATTGTACTTAAGAAAATTAA
ATAAGACATGGTTTAAAATAAAGCACAAGACACATGCTTTATTCGTCTTG
MMTATCGGCCCATTATGGATAAATCCCCCTGAGCCTGGGCAACAAATCCT
ATATGTAGGCATCCAAAACTTCCCTAAAGAGTCTTTAAACTAAGTGATAG
AGGGCAACCCAATTATGAATTTGCAGCGTGAATGTGCGACTCTATATTGA
AACTTTAATGAGTCTTTTTTTTATCGATAATGGCCAAAATTTAACACTCA
ATTTCATAAATGTTATTTTTTATAAAATCTTTCAACAAAAACAAAAAATC
CACTTAAATAGACTTAAATACTCTCAAAAATTAAAACCAAATAAACATAA
ACTAAACAACTCTAGGTTAGCCAAGAACCATAAGCAATAAGATTTGCACA
GCCCTCAGCCACATCATTGTTCCCAACTTCCTTGTCGTACCCACCACCAA
CAAAAATTGCTGCCAACAATGAAGGTACCATTAAAAGCCTTTCTCATGGG
TACAAGACCGTGGGAGCAATCACTATTTTTCTCCAACTGTCTTCATCCTT
GGCTCAACCATATGGCACTACAAGATCCATATTTGTTCAATGAATTGGCC
AGATAAAGGCCCAATGCTTTCGAAGCGGCGTCTCGAGCAACCGAGCTTCA
ACACTAGTAGCAATAATGGGGATCGATCTTGTGGCAGGAGGTAAGAGTAA
GAAGATGAAGCGCACTGGGCCTAGGTCCGATGATATCTATCTCAAGCTTC
TCGCCCAGCTGTATTGTTTTGTTGTCCGGAGGACTAGAAGCAAGTCGAAT
GCAGTCATTCTTAAATGCTTGTTCATGAGGAAAGTCAACAAGACACCACT
TTCTCTCTCGAGGTTGATTAAGTATATGCAAGGAAAGGACAACAAGATTG
CTGTGGTTGTGGGGACTGTTACCGATGACATTAGGGTTTATGAAGTTCCA
TAATTGAGGTTACAACACTTCTATGTAGATAGTTTTGGACTTTGAGGGTA
TTTAGGTCTATTCATGTGAGTTTTTTTTGCTATATTTGAAAGTTTTTATA
AAAAGTGATATTCATAAAATTTGGATGTTWAATTTTGGCTATTAATGATA
AATACTCAACTTTAATGGTGAAATAATAATTTTTATAATAAAAAATATTA
CGAAAAATATTGTGTTCAAAGTTTTGACGTGTTTGCCAAATGTTTATTGT
CTTATGTTGGCCCAAGGGCCCAACAAATAGAATCACAACGAAAGTAAGCC
CAATGATTTAATATAGTTAGCCCACGGGCCGAAGTAATACGGTTAGGTCG
TAAACACCAATAAAGAAAACCCAAGGACTGAACAGCAATAAACAAAAAGT
CTTATAAACCCTAGCCACCTCCTTGCTTTATATTCGTTGTTACAAATTCC
AAATTAGGGTTTCTGGTCGACYAACAGAAAGAAAGAGAGTGAGGGGGGCG
GCAGAGCTAAAGTCACCAGAAGCGGCACAGACTCTACAAGCCGGCAATCA
TGGGGCGTATGCACAGCAGAGGGTTCGTTCTCTTCTTATTTTCTAAACAA
GGCTCCTTGAGCCGTCGATTTAACTGGGATTTGATCCATTTTTCTTGGTG
GTTTTTGTGTTTTATGGTGTTTTGCAGAAAGGGTATTTCAGCTTTCAGCT
TTGCCGTACAAGAGGACCCCACCTAGCTGGTTGAAGATCTCAACCCAGGA
TGTGCGAAAACCCCGACTCTTTAACTCTTGAATGAATTTGAGTTGTTTTG
GGTTTTGTTTGGTTGATGAGAAAWGGGTTGCGTTTAGATTTGTTTGGCTG
ATGAGAAAATGGACTAAAGTTTGAATAGTTAGCTCAATTTTGTTCCCCAT
TGTTGGAAAATCTATGTTGATACCCAATTGGTCTTTGATTGTAAAAGATG
TAAAATGAGTTTATGATTTCATTTATGGGTATTTTTTTAATATTAATTTT
GGCAACCAGGCAGTATTTAATTGGTTAATCTGTTTTTCTGTGTTCTGTTT
CTGTTGATTGATTGATGAAGAAATGTAGTGAGAAAAAAATAGATTTTGAT
ATCATAATGTTGGTCTAAAAATAAAAGCTGAACAATTTTTATTGTTAACT
AGTGTATACCTTTGTTTAGCTGACCTCACTTAGTGGGATAAAGCTTTGTT
GTTGTTGTAGTATATACTTTTGTTTCTTATAGTCTGCTACTGCATTGTGA
TGTAGTTAACTTATATTATCTGTGTTTATGTATCGCTTATCTAACATTGA
GAACCGTAGTAACTGTTCCTTTTGTTTGGTTGTAGTTCCATGGTTTTTTC
AATTGTATAGTAATCTTCGAGTGTATTTTCTGCCCATGGTCACTTAATCA
ATTTTGTTTGGCCTCTTAATACACAATAAACGGTGACACAACTCTGTGTC
TGCTTCATGCCTTTTCCCATTTAATCTGCGTTGCTGAATAGAAATTTGGT
TATTTTTTGAACTACTGATTGTTCAAGGGAAATAATTTCTTACTGCAGTA
GACCTAAAACTTAAATTTGTGTCTTGTGCATTTTGGCTTAATTGCTTATC
TGGTTGTTTTTTGCCTTTTAGGTTGAGGAGAACATCTGCAAGTTTGCGAA
AAAGGGTCTGACACCCTCTCAAATTGGTGTTATTCTTCGTGATTCTCACG
GTATTGCTCAGGTGAAGAGTGTCACTGGAAGCAAGATCTTGCGTATTCTG
AAGGCTCATGGTGCGTATCTTGAATTTATTTTCATGATAACATATATTTT
TGTAGGAAAGAAATTTTGAAAATGATATCTTATATTTTCTTTTGGTGTGG
GTAGGTCTTGCTCCTGAAATTCCTGAGGATCTTTACCATCTGATCAAGAA
GGCTGTTTCAATCAGGAAGCATTTGGAGAGGAATAGGAAGGACAAGGATT
CTAAATTTAGACTGATTCTGGTTGAGAGCAGAATCCATCGCCTTGCTCGT
TACTACAAGAAGACAAAGAAGCTTCCACCAGTCTGGAAGTAG

protein sequence of MDP0000753788

>MDP0000753788 ID=MDP0000753788; Name=MDP0000753788; organism=Malus x domestica; type=polypeptide; length=554bp
MRVDSPKPRPISAQSRAQLAPRGLTPSVLDKVGPTIKGDVGHHHEPNGSF
VHLTADIFGPLVDPTMPREHIRGRNWTCEEDVALCLAWVSVSEDGAVGMN
QNKKVLWDKIIEKFHENCDDGGRDDDGVYDRWKTINKACTLWKGSLERAV
VGMASGRSAAEILQHAWDVLKDFPRWGTDADQQWGKLFQCEAAPTNVIDE
GVNEGVDEMTPTPSFARPSGRDKQKEGKRKGKSQDPMSGHISHVGDPHID
NHMEPRELSIHARLREPTYHVAVHAKYPHIDNCLEPRELILQSGSRGPTH
HVALLIKAQCFRSGVSSNRASTLVAIMGIDLVAGGKSKKMKRTGPRSDDI
YLKLLAQLYCFVVRRTRSKSNAVILKCLFMRKVNKTPLSLSRLIKYMQGK
DNKIAVVVGTVTDDIRRVRGAAELKSPEAAQTLQAGNHGAYAQQRVEENI
CKFAKKGLTPSQIGVILRDSHGIAQVKSVTGSKILRILKAHGLAPEIPED
LYHLIKKAVSIRKHLERNRKDKDSKFRLILVESRIHRLARYYKKTKKLPP
VWK*

mRNA from alignment at chr5:19237642..19248733-

Legend: CDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>MDP0000753788 ID=MDP0000753788; Name=MDP0000753788; organism=Malus x domestica; type=mRNA; location=Sequence derived from: chr5:19237642..19248733- (Malus x domestica

mRNA from alignment at MDC000132.393:3639..14730-

Legend: CDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>MDP0000753788 ID=MDP0000753788; Name=MDP0000753788; organism=Malus x domestica; type=mRNA; length=11092bp; location=Sequence derived from: MDC000132.393:3639..14730- (Malus x domestica
ATGCGTGTGGACTCGCCCAAGCCCAGGCCAATCTCGGCCCAGTCACGCGC
TCAACTCGCCCCACGCGGGTTGACGCCTTCAGTGCTCGACAAGGTGGGGC
CCACTATCAAGGGAGATGTTGGCCACCATCATGAGCCCAACGGCTCTTTT
GTTCATCTGACGGCTGACATTTTTGGACCGTTGGTTGATCCAACGGTCCA
GATTCAAATTTTTTTTATTAAAATGTTATTTTAAAATACATTGAATCCAA
CGGCTGAGATCGAATATAAACAAATCTAACGGTAAAAAAAAATTATCTAA
CGGCCCAAATTTAAATCCAACGGCTAAAATAATTATAAAAAAAAAAWATA
TATATATATATATATATATATATATATATATAACTCAAAATTCACCAAAA
AAACTCTATGAATACCTATGTATTTGTTCAAACATCCACATAAAACTCAC
ATTTCTCCTACAATTATTCCAATTTTTCTTTCTACCATTTCTTCCCATTT
CCAAATTTTTCAAGATGCCAAGAGAGCATATTAGAGGTCGTAATTGGACC
TGTGAGGAAGATGTTGCTTTATGCTTGGCATGGGTTTCTGTTAGCGAAGA
TGGTGCAGTTGGCATGAATCAAAATAAAAAGGTTTTGTGGGATAAAATCA
TTGAAAAGTTTCATGAAAACTGCGACGACGGCGGGAGGGACGATGATGGT
GTCTACGATCGGTGGAAGACTATCAACAAAGCATGCACTTTATGGAAGGG
AAGCTTGGAGAGAGCCGTGGTTGGCATGGCTAGTGGAAGAAGCGCCGCGG
AAATTGTGAGTTTTTTTGTTGATATTTTATTTGTCATGTACATAATATTA
TTTTGCAACTAATTGTTTTTATGTATTTTTTGCATAGGGTGACAAAGGAA
TGGAAATTTACAAGACAAGAGTAACACCAAAAAAATCAAGTTTTTAAGTT
GCAACATGCTTGGGACGTCCTCAAGGATTTTCCGAGGTGGGGAACCGATG
CAGACCAACAATGGGGAAAATTATTTCAATGTGAAGCCGCACCAACAAAT
GTCATTGATGAAGGTGTCAATGAAGGTGTCGATGAAATGACCCCAACTCC
TTCTTTTGCAAGGCCCTCGGGAAGAGATAAACAAAAGGAGGGAAAGAGAA
AAGGGAAGTCCCAAGATCCAATGAGTGGACACATTGTGTTTCACATGTGT
TCTATGTGTTTCACATGTGTTTTGTATGTGTTTCGTGTGTGTCATGTGTT
TCACATGTGTTCTATGTGTGCTTCATCTCTATCATGTGTTTTGTATGTCC
TTCACATGTGTATGTGCTTCACATGTGTTCTGTGTGTGTCTTGTGTGTTT
TATGTATTTTGTGTTTATACATCTCTATCATGATTTTCATATTCTTCCAT
AGTGTTTCATGAGTTTCATGTATTGATTTAGTGATTTTTCAATATTTATC
GGAATTTAAATATTTTWAAATTAAAATGTTCATAAAATTAATTTACGATA
TAGTCTACATTATTTTTTTAAAGTAAATTTAAGAAAAAAWTWAGCCTAAA
TTCATTCTTTAATAATCTGGGTCTAAAATTTAGGCCAAAATGGTTGATGA
AGCAGAAAAGTTGTTTCTAGGCTAAAAGCTAAATTTTCTGGKTTAAAAAT
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GAAAAAGAAATTTAAAAGAAAGCAATCATGCCATCCCTTTTAAAGGATTT
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TCCCCGTTTAAAATGGACCATGGTACAACTTTAAAGACAATGGTGGGATT
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AAGGGAGTGAAGCGAGGCGAGCTGATAAATATCCGATATTGTTTCTCTCC
GCTGGTTCTCACTATGCTCCACTGTTTTCATTATTCATTCCAACACATGT
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TAAATTTGTCAAATTATCAGAGAGATAGACCAAAGATCCACTTCCAAAGG
TCCATTTCTAATCACATCGATATTTTCCCCAACTTATTAATKATCACTTG
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GGAGTGAAATTATGATATTTAAACTCTTCTTTTTTCAAAAATACGGTCGA
TGTGGGATATTTCAACACACTCCCTCACTTGAAAGTTGGAACCCAATTTG
TGAGTCACATGTGGGAGATCCACACATCGACAACCACATGGAGCCAAGAG
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TGGAGTGAAGTTATGATATTTAAACTCTTTTTTTTTATTTTTTTTTTTGA
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TGAATATCAATCTCTCAAAGCTCATGCAAATCCAAACCCAAGTACATAGA
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ATGATCCTCACAACAAGGATCAAGAGAGGATCCTGTTGGGTAAAACACAT
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ATCTGTTCATCGTACRTCATGAGRTCAATTTTCGTTAGATACTATTTATG
TTAATTTGAAATTAAAAAATTTGAAATAATTTGCAACCACACAATGTACA
ATAAATGAATAAGATGTGAAAATCTTTAAAATTCTTCGAATGGAATCCAA
ATACGATTTTTGAGAGCACCACAGATAATTGCAACTACCCAACTAGATAA
TGCCTTTCACCACAAATTAAGAAAAARKWAAAAAAWWCAGTTATAATTAA
AGAATGAGGATCCTCTCAGGATCCTCTTTATGAAGATCTCGAAGATCATC
CAATCACATCCATTCATCGTATATYGTGCGGTTAATTTTCGTCATGTATT
ATTTATATTTAATTATAAATAAAAAAAAWATACAATGATTTATGATAGAA
TRATATATGATGAACAAATGTAATTAAATTATTCTCAAAATCCTCATAAA
AAGAATCCAAAGAAATCCTCATTCATAATTAAATATTTATGCATAATATG
TGACATATTGTCATATATTGGTTACTAGAGCTGGCTCGTGATCGATCCAT
AGCTTTTCCTAGGCCACCTACTTCAATCGTAGGCTAACCTAAAATATCCC
AATACTAAGAAAGTACACGCACATCAACCTTTTGAGCTTTCCTAAATTTA
ATTGACTCTGGTTAATCTGTACCTAATACTCTAGATCAAATTATGACATT
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GTCATGCACTCCATTTGTATAGTGTTTTAATAGGTGTTTATGGGAGATGA
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TTCTTTGTAAAATTGGCTTTTTGCCCTGGTTAATAATATAGCCACTTTAA
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TTTCCAATCCATATTTACCAACCGTCTTCACACCATTATCAATTTAAGGC
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TTTTTGCCAAGAATACATTGAATAAGAAAAATTTCAACACATATAAAAAA
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GATGGTATTCATTTTCATTTGTAAGTGAGAGGTCTTAGGTTCGAATTTTG
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AAAAGTGATATTCATAAAATTTGGATGTTWAATTTTGGCTATTAATGATA
AATACTCAACTTTAATGGTGAAATAATAATTTTTATAATAAAAAATATTA
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TACTACAAGAAGACAAAGAAGCTTCCACCAGTCTGGAAGTAG

Coding sequence (CDS) from alignment at MDC000132.393:3639..14730-

>MDP0000753788 ID=MDP0000753788; Name=MDP0000753788; organism=Malus x domestica; type=CDS; length=1662bp; location=Sequence derived from: MDC000132.393:3639..14730- (Malus x domestica
ATGCGTGTGGACTCGCCCAAGCCCAGGCCAATCTCGGCCCAGTCACGCGC
TCAACTCGCCCCACGCGGGTTGACGCCTTCAGTGCTCGACAAGGTGGGGC
CCACTATCAAGGGAGATGTTGGCCACCATCATGAGCCCAACGGCTCTTTT
GTTCATCTGACGGCTGACATTTTTGGACCGTTGGTTGATCCAACGATGCC
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Annotated Terms

The following terms have been associated with this mRNA:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR000589	Ribosomal_uS15
IPR009068	uS15_NS1_RNA-bd_sf
IPR012606	Ribosomal_uS15_N
IPR021131	Ribosomal_uL15/eL18

Vocabulary: **Molecular Function**
Term	Definition
GO:0003735	structural constituent of ribosome

Vocabulary: **Cellular Component**
Term	Definition
GO:0005622	intracellular anatomical structure
GO:0005840	ribosome

Vocabulary: **Biological Process**
Term	Definition
GO:0006412	translation